[Vennerable-commits] r52 - in pkg/Vennerable: R inst/doc
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Sun Sep 13 01:15:50 CEST 2009
Author: js229
Date: 2009-09-13 01:15:48 +0200 (Sun, 13 Sep 2009)
New Revision: 52
Modified:
pkg/Vennerable/R/03VennDrawing.R
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Modified: pkg/Vennerable/R/03VennDrawing.R
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+++ pkg/Vennerable/R/03VennDrawing.R 2009-09-12 23:15:48 UTC (rev 52)
@@ -100,7 +100,7 @@
gpList[["FaceText"]] <- FaceTextColours(drawing=drawing,colourAlgorithm=colourAlgorithm)
}
if (is.null(gpList[["Set"]])) {
- gpList[["Set"]] <- SetColours(drawing=drawing)
+ gpList[["Set"]] <- SetColours(drawing=drawing,colourAlgorithm=colourAlgorithm)
}
if (is.null(gpList[["SetText"]])) {
gpList[["SetText"]] <- SetTextColours(drawing=drawing)
@@ -180,13 +180,20 @@
-SetColours <- function(drawing ) {
+SetColours <- function(drawing,colourAlgorithm) {
+ if (missing(colourAlgorithm)) { colourAlgorithm <- "sequential"}
nSets <-length(drawing at setList)
- fillcols <- brewer.pal(9,'Set1')
- if (nSets > length(fillcols)) {
- fillcols <- rep(fillcols,times=1+nSets/length(fillcols))
+ if (colourAlgorithm=="binary") {
+ setcolours <-rep("blue",nSets)
+ names(setcolours) <- names(drawing at setList)
+ } else {
+ fillcols <- brewer.pal(9,'Set1')
+ if (nSets > length(fillcols)) {
+ fillcols <- rep(fillcols,times=1+nSets/length(fillcols))
+ }
+ setcolours <-fillcols[1:nSets];
+ names(setcolours) <- names(drawing at setList)
}
- setcolours <-fillcols[1:nSets]; names(setcolours) <- names(drawing at setList)
gp <- lapply(names(setcolours ),function(x)gpar(col=setcolours [[x]],fill=NA,lty=1,lwd=3));
names(gp) <- names(setcolours)
gp
Modified: pkg/Vennerable/inst/doc/TissueDrawingTest.pdf
===================================================================
--- pkg/Vennerable/inst/doc/TissueDrawingTest.pdf 2009-09-12 22:59:22 UTC (rev 51)
+++ pkg/Vennerable/inst/doc/TissueDrawingTest.pdf 2009-09-12 23:15:48 UTC (rev 52)
@@ -184,17 +184,19 @@
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+„j.BQ}Uç[õÙC+}^I"ÐJ íÉw¦X8*2ƒ#ØÂ÷Îyñ¨³;Ý%C„c„ÔD KØ{׽Ϟ݂ ¾;ÙZ
+½†– Äø[ôØÈ7¾ °'# Gãh³ÆNÞš‡i,ú; uïÆ–EýüI¶ˆ±W¥UVÓ kø¬ÃÃ㢇¾[¶±w‹©÷³:¬ï:/b6S &Îó¢k€ÝíÃÇqSVOÏã/c ÀjŠ0}œ§ tÕ*ŸÎ‡*äÌQä2Ú6Y»Üƒáí6í ‹<XTN”íÂ?”÷¿ò¢¿ ¾yÌÕÚfÍS˜ÿTùºîOòQ:kòyYù~|žVO³´ÈÖ]v„PŒr£I"
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