[Seqinr-commits] r1808 - www/src/misc

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Wed Jun 11 11:06:27 CEST 2014


Author: jeanlobry
Date: 2014-06-11 11:06:27 +0200 (Wed, 11 Jun 2014)
New Revision: 1808

Modified:
   www/src/misc/seqinRtodolist.txt
Log:
NS and NK are now documented

Modified: www/src/misc/seqinRtodolist.txt
===================================================================
--- www/src/misc/seqinRtodolist.txt	2014-06-11 09:02:13 UTC (rev 1807)
+++ www/src/misc/seqinRtodolist.txt	2014-06-11 09:06:27 UTC (rev 1808)
@@ -53,14 +53,8 @@
 
 ------ PENDING --------
 
-o D'un e-mail de Manolo du 05-MARS-2007 :
-  QUOTE
-  J'ai ajoute 2 criteres de selection:
-  NS= et NK= pour mettre une espece ou un mot-cle (@ possible) dans une liste
-  UNQUOTE
-  --> Mettre a jour la doc de query() et le manuel.
-  --> Doc query.Rd mise à jour dans 3.0-11, reste manuel à faire.
 
+
 o Le probleme du controsle trop strict sur acgt comme seuls chars acceptes. 
   Faire une option professionnelle read.fasta(checkIUPAC= c("dnastrict", "dnaambiguous",
   aastrict","aaambiguous","relax"), gapallowed = FALSE, gapchar = "-", forcetolower = FALSE)
@@ -70,6 +64,13 @@
 o Mettre la doc a jour sur la gestion des caracteres ambigus dans la vignette.
 
 ------ TOUT CA, CA A DEJA ETE FAIT ---
+o D'un e-mail de Manolo du 05-MARS-2007 :
+  QUOTE
+  J'ai ajoute 2 criteres de selection:
+  NS= et NK= pour mettre une espece ou un mot-cle (@ possible) dans une liste
+  UNQUOTE
+  --> Mettre a jour la doc de query() et le manuel.
+  --> Doc query.Rd et querylang.rnw mise à jour dans 3.0-11.
 
 o faire de m16.seq un dataset standard (oriC chez E. coli). --> 1.1-3
 



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