[Rnomads-user] Error in system(paste0("wgrib ", grib.file), " -s", intern = TRUE) : 'ignore.stdout' must be TRUE or FALSE

[Daniel Bowman]

Grib format (rather than the newer grib2) is tough to work with although I
think there are some R packages that can read it.

On Sun, Jan 7, 2018 at 15:28 Pere Lopez Brosa <pere.lopez at ub.edu> wrote:

> Hi.
>
> The fix seems to work:
>
> > library(rNOMADS)
> > source("E:/pere/ReadGrib.R")
> > GribInfo("E:\\pere\\terbolesa\\test\\wrf-03.2017122800_16_pcp.grib",
> +          file.type = "grib1")
> $inventory
> [1] "1:0:d=17122800:APCP:sfc:0-16hr acc:NAve=0"
>
> $grid
> NULL
>
> I still have to learn to understant the result, but that's a different
> issue.
>
> Thank you.
>
> Pere
> ________________________________________
> De: Daniel Bowman [danny.c.bowman at gmail.com]
> Enviat el: diumenge, 7 / gener / 2018 04:48
> Per a: Announcements, feature requests, and help using rNOMADS; Pere Lopez
> Brosa
> Tema: Re: [Rnomads-user] Error in system(paste0("wgrib ", grib.file), "
> -s", intern = TRUE) : 'ignore.stdout' must be TRUE or FALSE
>
> Hi Pere,
>
> You have indeed found a bug.  The attached update should fix the
> issue.  Please tell me how it works.  If it solves your problem, I'll
> release a new version of rNOMADS with the fix included.
>
> How to use the file:
>
> library(rNOMADS)
> source("ReadGrib.R")
>
> Best,
>
> Danny
>
> On Thu, Jan 4, 2018 at 5:07 PM, Pere Lopez Brosa <pere.lopez at ub.edu>
> wrote:
> > Hello.
> >
> > I'm getting an error when trying to perform GribInfo on a downloaded grib
> > file:
> >
> >> GribInfo("E:\\pere\\terbolesa\\test\\wrf-03.2017122800_16_pcp.grib",
> > +          file.type = "grib1")
> > Error in system(paste0("wgrib ", grib.file), " -s", intern = TRUE) :
> >   'ignore.stdout' must be TRUE or FALSE
> >
> > I tried adding ignore.stdout parameter (and later ignore.stderr and wait
> > parameters) to GribInfo code and it seems to work, although I'm new to
> grib
> > files and rNOMADS and I don't know if I'm getting the expected result.
> > However, I copy here the modified line:
> >
> >     inv <- system(paste0("wgrib ", grib.file), " -s", intern = TRUE,
> >                   ignore.stdout=FALSE,
> >                   ignore.stderr=FALSE,
> >                   wait=TRUE)
> >
> > I tried it with R versions 3.4.2 and 3.4.3, and the latest rNOMADS
> release.
> >
> > Have I found a bug or it's just that I'm doing something wrong?
> >
> > Regards.
> >
> > Pere López Brosa
> >
> >
> > Aquest correu electrònic i els annexos poden contenir informació
> > confidencial o protegida legalment i està adreçat exclusivament a la
> persona
> > o entitat destinatària. Si no sou el destinatari final o la persona
> > encarregada de rebre’l, no esteu autoritzat a llegir-lo, retenir-lo,
> > modificar-lo, distribuir-lo, copiar-lo ni a revelar-ne el contingut. Si
> heu
> > rebut aquest correu electrònic per error, us preguem que n’informeu al
> > remitent i que elimineu del sistema el missatge i el material annex que
> > pugui contenir. Gràcies per la vostra col·laboració.
> >
> > Este correo electrónico y sus anexos pueden contener información
> > confidencial o legalmente protegida y está exclusivamente dirigido a la
> > persona o entidad destinataria. Si usted no es el destinatario final o la
> > persona encargada de recibirlo, no está autorizado a leerlo, retenerlo,
> > modificarlo, distribuirlo, copiarlo ni a revelar su contenido. Si ha
> > recibido este mensaje electrónico por error, le rogamos que informe al
> > remitente y elimine del sistema el mensaje y el material anexo que pueda
> > contener. Gracias por su colaboración.
> >
> > This email message and any documents attached to it may contain
> confidential
> > or legally protected material and are intended solely for the use of the
> > individual or organization to whom they are addressed. We remind you
> that if
> > you are not the intended recipient of this email message or the person
> > responsible for processing it, then you are not authorized to read, save,
> > modify, send, copy or disclose any of its contents. If you have received
> > this email message by mistake, we kindly ask you to inform the sender of
> > this and to eliminate both the message and any attachments it carries
> from
> > your account. Thank you for your collaboration.
> >
> >
> >
> > Aquest correu electrònic i els annexos poden contenir informació
> > confidencial o protegida legalment i està adreçat exclusivament a la
> persona
> > o entitat destinatària. Si no sou el destinatari final o la persona
> > encarregada de rebre’l, no esteu autoritzat a llegir-lo, retenir-lo,
> > modificar-lo, distribuir-lo, copiar-lo ni a revelar-ne el contingut. Si
> heu
> > rebut aquest correu electrònic per error, us preguem que n’informeu al
> > remitent i que elimineu del sistema el missatge i el material annex que
> > pugui contenir. Gràcies per la vostra col·laboració.
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> > Este correo electrónico y sus anexos pueden contener información
> > confidencial o legalmente protegida y está exclusivamente dirigido a la
> > persona o entidad destinataria. Si usted no es el destinatario final o la
> > persona encargada de recibirlo, no está autorizado a leerlo, retenerlo,
> > modificarlo, distribuirlo, copiarlo ni a revelar su contenido. Si ha
> > recibido este mensaje electrónico por error, le rogamos que informe al
> > remitente y elimine del sistema el mensaje y el material anexo que pueda
> > contener. Gracias por su colaboración.
> >
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> > or legally protected material and are intended solely for the use of the
> > individual or organization to whom they are addressed. We remind you
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> > responsible for processing it, then you are not authorized to read, save,
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> > this email message by mistake, we kindly ask you to inform the sender of
> > this and to eliminate both the message and any attachments it carries
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> received this email message by mistake, we kindly ask you to inform the
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> carries from your account. Thank you for your collaboration.
>
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> confidencial o protegida legalment i està adreçat exclusivament a la
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> you that if you are not the intended recipient of this email message or the
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