[CHNOSZ-commits] r666 - in pkg/CHNOSZ: . inst inst/extdata/OBIGT

noreply at r-forge.r-project.org noreply at r-forge.r-project.org
Wed Apr 7 08:38:17 CEST 2021


Author: jedick
Date: 2021-04-07 08:38:16 +0200 (Wed, 07 Apr 2021)
New Revision: 666

Modified:
   pkg/CHNOSZ/DESCRIPTION
   pkg/CHNOSZ/inst/NEWS.Rd
   pkg/CHNOSZ/inst/TODO
   pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/Berman_cr.csv
Log:
OBIGT/Berman_cr.csv: use standard abbreviations for more minerals


Modified: pkg/CHNOSZ/DESCRIPTION
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/DESCRIPTION	2021-04-07 06:14:08 UTC (rev 665)
+++ pkg/CHNOSZ/DESCRIPTION	2021-04-07 06:38:16 UTC (rev 666)
@@ -1,6 +1,6 @@
 Date: 2021-04-07
 Package: CHNOSZ
-Version: 1.4.0-35
+Version: 1.4.0-36
 Title: Thermodynamic Calculations and Diagrams for Geochemistry
 Authors at R: c(
     person("Jeffrey", "Dick", , "j3ffdick at gmail.com", role = c("aut", "cre"),

Modified: pkg/CHNOSZ/inst/NEWS.Rd
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/inst/NEWS.Rd	2021-04-07 06:14:08 UTC (rev 665)
+++ pkg/CHNOSZ/inst/NEWS.Rd	2021-04-07 06:38:16 UTC (rev 666)
@@ -19,7 +19,7 @@
       lines, after \href{https://www.worldcat.org/oclc/563921897}{Pourbaix,
       1974}). This demo depends on the following two changes.
 
-      \item Revamp \code{solubility()} to enable calculating overall (i.e.
+      \item Revise \code{solubility()} to enable calculating overall (i.e.
       minimum) solubility for multiple minerals. Calculations for multiple
       minerals are also now used in \samp{demo/zinc.R}.
 
@@ -35,8 +35,10 @@
   \subsection{DATA UPDATES}{
     \itemize{
 
-      \item \samp{OBIGT/Berman_cr.csv}: Use standard abbreviations for hematite
-      (Hem) and magnetite (Mag).
+      \item \samp{OBIGT/Berman_cr.csv}: Where possible, use standard
+      abbreviations for mineral names (including hematite (Hem) and magnetite
+      (Mag)), as listed by \href{https://doi.org/10.2138/am.2010.3371}{Whitney
+        and Evans (2010)}.
 
       \item \samp{OBIGT/organic_aq.csv}: Add properties of aqueous fatty acids,
       saccharides, and other species, and add associated \samp{demo/E_coli.R}
@@ -73,7 +75,7 @@
       \item In the return value of \code{diagram()}, \code{predominant.values}
       previously only contained affinities (extracted from the \code{values}
       element of the \code{eout} argument). Now it has the values for the
-      predominant species extracted from the actual values used to make the
+      predominant species extracted from the values actually used to make the
       plot (the \code{plotvals} list in the output), i.e.  affinities divided
       by the balancing coefficients if \code{eout} is the output of
       \code{affinity}, or activities if \code{eout} is the output of
@@ -88,7 +90,7 @@
       calculation (\href{https://doi.org/10.1016/j.gca.2021.01.038}{Robinson et
       al., 2021}); add Δ\emph{G}\s{pbx} color scale.
 
-      \item Rename \samp{demo/berman.R} to \samp{potassium.R}.
+      \item Rename \samp{demo/berman.R} to \samp{demo/potassium.R}.
 
       \item Remove unused limSolve package from Suggests in DESCRIPTION.
 
@@ -95,8 +97,9 @@
       \item Add option \code{thermo()$opt$ionize.aa} to control calculation of
       properties of ionized proteins in \code{affinity()}.
 
-      \item Fix bug where protein ionization calculations were incorrected
-      affected by the setting of \code{E.units()}.
+      \item Fix bug where protein ionization calculations with
+      \code{ionize.aa()} were incorrectly affected by the setting of
+      \code{E.units()}.
 
     }
   }

Modified: pkg/CHNOSZ/inst/TODO
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/inst/TODO	2021-04-07 06:14:08 UTC (rev 665)
+++ pkg/CHNOSZ/inst/TODO	2021-04-07 06:38:16 UTC (rev 666)
@@ -32,10 +32,6 @@
 
 - Fix formatting of messages from palply() (seen with read.fasta())
 
-[20210219]
-
-- Check all mineral abbreviations in Berman_cr.csv.
-
 [20210301]
 
 - anintro.Rmd: change red to blue for sulfur basis species

Modified: pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/Berman_cr.csv
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/Berman_cr.csv	2021-04-07 06:14:08 UTC (rev 665)
+++ pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/Berman_cr.csv	2021-04-07 06:38:16 UTC (rev 666)
@@ -8,26 +8,26 @@
 anorthite,An,Al2CaSi2O8,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 anthophyllite,Ath,Mg7Si8O24H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 antigorite,Atg,Mg48Si34O99H62O48,cr,Ber88,BDat17.1,2017-10-09,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-brucite,Br,MgO2H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+brucite,Brc,MgO2H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 Ca-Al-pyroxene,CTs,CaAl2SiO6,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-calcite,Cc,CaCO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-chrysotile,Chr,Mg3Si2O9H4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+calcite,Cal,CaCO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+chrysotile,Ctl,Mg3Si2O9H4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 clinochlore,Chl,Mg5Al2Si3O18H8,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-coesite,Cs,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-cordierite,Cd,Mg2Al4Si5O18,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-corundum,Co,Al2O3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"cristobalite,alpha",aCr,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"cristobalite,beta",bCr,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+coesite,Coe,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+cordierite,Crd,Mg2Al4Si5O18,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+corundum,Crn,Al2O3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"cristobalite,alpha",aCrs,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"cristobalite,beta",bCrs,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 diaspore,Dsp,AlO2H,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 diopside,Di,MgCaSi2O6,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-dolomite,Do,MgCaC2O6,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"enstatite,clino",cEn,MgSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+dolomite,Dol,MgCaC2O6,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"enstatite,clino",Cen,MgSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 enstatite,En,MgSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 "enstatite,proto",pEn,MgSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 fayalite,Fa,Fe2SiO4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-ferrosilite,Fsl,SiFeO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+ferrosilite,Fs,SiFeO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 forsterite,Fo,Mg2SiO4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-gehlenite,Ge,Al2Ca2SiO7,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+gehlenite,Gh,Al2Ca2SiO7,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 grossular,Grs,Ca3Al2Si3O12,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 hematite,Hem,Fe2O3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 ilmenite,Ilm,FeTiO3,cr,Ber88,Ber90.1,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
@@ -34,48 +34,48 @@
 jadeite,Jd,NaAlSi2O6,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 kaolinite,Kln,Al2Si2O9H4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 kyanite,Ky,Al2SiO5,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-lawsonite,Lw,CaAl2Si2O10H4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+lawsonite,Lws,CaAl2Si2O10H4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 lime,Lm,CaO,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 magnesite,Mst,MgCO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-magnetite,Mag,Fe3O4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+magnetite,Mgs,Fe3O4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 margarite,Mrg,CaAl4Si2O12H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-meionite,Me,Ca4Al6Si6O27C,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+meionite,Mei,Ca4Al6Si6O27C,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 merwinite,Mw,Ca3MgSi2O8,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-monticellite,Mo,CaMgSiO4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+monticellite,Mtc,CaMgSiO4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 muscovite,Ms,KAl3Si3O12H2,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 paragonite,Pg,NaAl3Si3O12H2,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-periclase,Pe,MgO,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+periclase,Per,MgO,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 phlogopite,Phl,KMg3AlSi3O12H2,cr,Ber88,SHD91.1,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 K-feldspar,Kfs,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 "K-feldspar,high",Sa,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"K-feldspar,low",Mcr,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"K-feldspar,low",Mc,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 prehnite,Prh,Ca2Al2Si3O12H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-pyrope,Py,Mg3Al2Si3O12,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+pyrope,Prp,Mg3Al2Si3O12,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 pyrophyllite,Prl,Al2Si4O12H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-quartz,aQz,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+quartz,Qz,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 "quartz,beta",bQz,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 rutile,Rt,TiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-sillimanite,Si,Al2SiO5,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-sphene,Sph,CaTiSiO5,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-spinel,Sp,MgAl2O4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-talc,Tc,Mg3Si4O12H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+sillimanite,Sil,Al2SiO5,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+sphene,Spn,CaTiSiO5,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+spinel,Spl,MgAl2O4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+talc,Tlc,Mg3Si4O12H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 tremolite,Tr,Ca2Mg5Si8O24H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"tridymite,high",hTr,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"tridymite,low",lTr,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"tridymite,high",hTrd,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"tridymite,low",lTrd,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 wollastonite,Wo,CaSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 pseudowollastonite,pWo,CaSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 annite,Ann,Si3Fe3AlKH2O12,cr,Ber90,SHD91.2,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 fluormuscovite,Flms,KAl3Si3O10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 fluorphlogopite,Fphl,KMg3AlSi3O10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-fluorannite,Flan,Si3Fe3AlKO10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+fluorannite,Flann,Si3Fe3AlKO10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 fluortremolite,Fltr,Ca2Mg5Si8O22F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 fluorapatite,Flap,Ca5P3O12F,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 hydroxyapatite,Hyap,Ca5P3O13H,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 chlorapatite,Clap,Ca5P3O12Cl,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-fluortalc,Fltc,Mg3Si4O10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+fluortalc,Fltlc,Mg3Si4O10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 chlorphlogopite,Cphl,KMg3AlSi3O10Cl2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-chlorannite,Clan,Si3Fe3AlKO10Cl2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-glaucophane,Glc,Na2Al2Mg3Si8O24H2,cr,Eva90,JUN92,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+chlorannite,Clann,Si3Fe3AlKO10Cl2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+glaucophane,Gln,Na2Al2Mg3Si8O24H2,cr,Eva90,JUN92,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 pumpellyite,Pmp,Ca4Al5MgSi6O28H7,cr,Eva90,JUN92,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 aragonite,Arg,CaCO3,cr,FDM+14.1,NA,2017-10-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 hedenbergite,Hd,CaFeSi2O6,cr,DS10,NA,2017-11-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
@@ -84,10 +84,10 @@
 grunerite,Gru,Fe7Si8O22(OH)2,cr,DS10,NA,2017-11-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 ilvaite,Ilv,CaFe2FeSi2O7O(OH),cr,DS10,NA,2017-11-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 sudoite,Sud,Mg2Al4Si3O10(OH)8,cr,VGT92,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-daphnite,Daph,Fe5Al2Si3O10(OH)8,cr,VPT01,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-Mg-amesite,Mg-Am,Mg4Al4Si2O10(OH)8,cr,VPT01,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-Fe-amesite,Fe-Am,Fe4Al4Si2O10(OH)8,cr,VPV05,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+daphnite,Dph,Fe5Al2Si3O10(OH)8,cr,VPT01,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+Mg-amesite,Mg-Ame,Mg4Al4Si2O10(OH)8,cr,VPT01,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+Fe-amesite,Fe-Ame,Fe4Al4Si2O10(OH)8,cr,VPV05,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 zoisite,Zo,Ca2Al3Si3O13H,cr,Got04,NA,2019-08-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-clinozoisite,cZo,Ca2Al3Si3O13H,cr,Got04,NA,2019-08-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+clinozoisite,Czo,Ca2Al3Si3O13H,cr,Got04,NA,2019-08-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 epidote,Ep,Ca2FeAl2Si3O12(OH),cr,Got04,NA,2019-08-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
 orthoepidote,oEp,Ca2FeAl2Si3O12(OH),cr,Got04,NA,2019-08-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA



More information about the CHNOSZ-commits mailing list