[CHNOSZ-commits] r600 - in pkg/CHNOSZ: . R inst inst/extdata/OBIGT inst/extdata/adds man tests/testthat vignettes
noreply at r-forge.r-project.org
noreply at r-forge.r-project.org
Sun Aug 16 13:09:19 CEST 2020
Author: jedick
Date: 2020-08-16 13:09:19 +0200 (Sun, 16 Aug 2020)
New Revision: 600
Modified:
pkg/CHNOSZ/DESCRIPTION
pkg/CHNOSZ/NAMESPACE
pkg/CHNOSZ/R/add.OBIGT.R
pkg/CHNOSZ/R/util.data.R
pkg/CHNOSZ/inst/NEWS.Rd
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/AS04.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/AkDi.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/Berman_cr.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/DEW.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/H2O_aq.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/OldAA.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/SLOP98.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/SUPCRT92.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/biotic_aq.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/inorganic_aq.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/inorganic_cr.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/inorganic_gas.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/organic_aq.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/organic_cr.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/organic_gas.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/organic_liq.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/adds/BZA10.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/adds/LA19_test.csv
pkg/CHNOSZ/inst/extdata/adds/SK95.csv
pkg/CHNOSZ/man/add.OBIGT.Rd
pkg/CHNOSZ/man/thermo.Rd
pkg/CHNOSZ/tests/testthat/test-mod.OBIGT.R
pkg/CHNOSZ/vignettes/OBIGT.bib
pkg/CHNOSZ/vignettes/anintro.Rmd
pkg/CHNOSZ/vignettes/eos-regress.Rmd
pkg/CHNOSZ/vignettes/mklinks.sh
Log:
OBIGT: Convert 'date' column to ISO 8601 extended format
Modified: pkg/CHNOSZ/DESCRIPTION
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/DESCRIPTION 2020-08-15 10:28:47 UTC (rev 599)
+++ pkg/CHNOSZ/DESCRIPTION 2020-08-16 11:09:19 UTC (rev 600)
@@ -1,6 +1,6 @@
Date: 2020-08-15
Package: CHNOSZ
-Version: 1.3.6-73
+Version: 1.3.6-74
Title: Thermodynamic Calculations and Diagrams for Geochemistry
Authors at R: c(
person("Jeffrey", "Dick", , "j3ffdick at gmail.com", role = c("aut", "cre"),
Modified: pkg/CHNOSZ/NAMESPACE
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/NAMESPACE 2020-08-15 10:28:47 UTC (rev 599)
+++ pkg/CHNOSZ/NAMESPACE 2020-08-16 11:09:19 UTC (rev 600)
@@ -11,7 +11,7 @@
"pinfo", "protein.length", "protein.formula",
"read.fasta", "protein.basis", "add.protein",
"unitize", "revisit", "seq2aa", "findit",
- "thermo.refs", "mod.OBIGT", "today",
+ "thermo.refs", "mod.OBIGT",
# examples
"examples", "demos", "mtitle",
"list2array", "slice", "dimSums", "slice.affinity",
Modified: pkg/CHNOSZ/R/add.OBIGT.R
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/R/add.OBIGT.R 2020-08-15 10:28:47 UTC (rev 599)
+++ pkg/CHNOSZ/R/add.OBIGT.R 2020-08-16 11:09:19 UTC (rev 600)
@@ -4,19 +4,6 @@
## if this file is interactively sourced, the following are also needed to provide unexported functions:
#source("info.R")
-today <- function() {
- # write today's date in the format used in SUPCRT data files
- # e.g. 13.May.12 for 2012-05-13
- t <- date()
- tt <- unlist(strsplit(t, " "))
- # for single-digit days there is an extra space
- tt <- tt[!tt==""]
- tday <- tt[3]
- tmonth <- tt[2]
- tyear <- substr(tt[5], start=3, stop=4)
- return(paste(tday, tmonth, tyear, sep="."))
-}
-
mod.OBIGT <- function(...) {
# add or modify species in thermo()$OBIGT
thermo <- get("thermo", CHNOSZ)
Modified: pkg/CHNOSZ/R/util.data.R
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/R/util.data.R 2020-08-15 10:28:47 UTC (rev 599)
+++ pkg/CHNOSZ/R/util.data.R 2020-08-16 11:09:19 UTC (rev 600)
@@ -366,7 +366,7 @@
stop(paste("formula", formula, "of", comate.dat[i], "(from groups) is not identical to", thisdat$formula, "(listed in file)" ))
# build the front part of OBIGT data frame
thishead <- data.frame(name=thisdat$compound, abbrv=NA, formula=formula, state=thisdat$state,
- ref1=NA, ref2=NA, date=today(), E_units = "cal", stringsAsFactors=FALSE)
+ ref1=NA, ref2=NA, date=as.character(Sys.Date()), E_units = "cal", stringsAsFactors=FALSE)
# insert the result into the output
out <- rbind(out, cbind(thishead, thiseos))
}
Modified: pkg/CHNOSZ/inst/NEWS.Rd
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/inst/NEWS.Rd 2020-08-15 10:28:47 UTC (rev 599)
+++ pkg/CHNOSZ/inst/NEWS.Rd 2020-08-16 11:09:19 UTC (rev 600)
@@ -9,7 +9,7 @@
\newcommand{\s}{\ifelse{latex}{\eqn{_{#1}}}{\ifelse{html}{\out{<sub>#1</sub>}}{#1}}}
\newcommand{\S}{\ifelse{latex}{\eqn{^{#1}}}{\ifelse{html}{\out{<sup>#1</sup>}}{^#1}}}
-\section{Changes in CHNOSZ version 1.3.6-73 (2020-08-15)}{
+\section{Changes in CHNOSZ version 1.3.6-74 (2020-08-16)}{
\subsection{MAJOR CHANGES}{
\itemize{
@@ -79,6 +79,10 @@
\subsection{CHANGES TO OBIGT DATABASE}{
\itemize{
+ \item Dates in the \samp{date} column have been converted to use ISO 8601
+ extended format (e.g. 2020-08-16). The accessory function \code{today},
+ to render the current date using the previous format, has been removed.
+
\item Update species parameters for the 2019 version of the Deep Earth
Water (DEW) model (\href{https://doi.org/10.1016/j.gca.2019.03.027}{Huang
and Sverjensky, 2019}).
@@ -254,8 +258,6 @@
\item TODO: move H2O92D.f and R wrapper to a separate package (so people
don't have to compile anything to install CHNOSZ updates).
- \item TODO: convert dates in OBIGT to ISO 8601 format (2020-08-12).
-
\item TODO: get entropies for Am, Pu, Cm, Np.
\item TODO: link to multi-metal.Rmd from anintro.Rmd.
Modified: pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/AS04.csv
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/AS04.csv 2020-08-15 10:28:47 UTC (rev 599)
+++ pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/AS04.csv 2020-08-16 11:09:19 UTC (rev 600)
@@ -1,4 +1,4 @@
name,abbrv,formula,state,ref1,ref2,date,E_units,G,H,S,Cp,V,a1.a,a2.b,a3.c,a4.d,c1.e,c2.f,omega.lambda,z.T
-H4SiO4,NA,H4SiO4,aq,Ste01,NA,31.Aug.06,cal,-312919.933078394,-348676.147227533,45.1003824091778,15.0095602294455,52.3,18.7299235181644,-21.2600382409178,18.6199808795411,-1.20004780114723,58.0305927342256,-20.789913957935,0.0869024856596558,0
-SiO2,NA,SiO2,aq,AS04,NA,08.Feb.19,cal,-199540,-212179,11.128325,-22.324515,15.575422,1.9,1.7,20,-2.7,32.221331,-25.288582,0.342671,0
-HSiO3-,HSiO3-,HSiO3-,aq,SSH97.2,CHNOSZ.8,08.Feb.19,cal,-243151,-276276,-1.871675,-21,5,2.9735,-0.5158,5.9467,-2.7575,8.1489,-7.3123,1.5511,-1
+H4SiO4,NA,H4SiO4,aq,Ste01,NA,2006-08-31,cal,-312919.933078394,-348676.147227533,45.1003824091778,15.0095602294455,52.3,18.7299235181644,-21.2600382409178,18.6199808795411,-1.20004780114723,58.0305927342256,-20.789913957935,0.0869024856596558,0
+SiO2,NA,SiO2,aq,AS04,NA,2019-02-08,cal,-199540,-212179,11.128325,-22.324515,15.575422,1.9,1.7,20,-2.7,32.221331,-25.288582,0.342671,0
+HSiO3-,HSiO3-,HSiO3-,aq,SSH97.2,CHNOSZ.8,2019-02-08,cal,-243151,-276276,-1.871675,-21,5,2.9735,-0.5158,5.9467,-2.7575,8.1489,-7.3123,1.5511,-1
Modified: pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/AkDi.csv
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/AkDi.csv 2020-08-15 10:28:47 UTC (rev 599)
+++ pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/AkDi.csv 2020-08-16 11:09:19 UTC (rev 600)
@@ -1,25 +1,25 @@
name,abbrv,formula,state,ref1,ref2,date,E_units,G,H,S,Cp,V,a1.a,a2.b,a3.c,a4.d,c1.e,c2.f,omega.lambda,z.T
-Ar,NA,Ar,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-8.5139,11.921,0.0733,NA,NA,NA,NA,NA
-H2S,NA,H2S,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-13.4046,13.8582,-0.2029,NA,NA,NA,NA,NA
-O2,NA,O2,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-9.754,12.9411,0.026,NA,NA,NA,NA,NA
-N2,NA,N2,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-11.538,14.6278,-0.032,NA,NA,NA,NA,NA
-NH3,NA,NH3,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-4.7245,4.9782,-0.0955,NA,NA,NA,NA,NA
-H2,NA,H2,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-8.4596,10.8301,0.309,NA,NA,NA,NA,NA
-CH4,NA,CH4,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-11.8462,14.8615,-0.1131,NA,NA,NA,NA,NA
-CO2,NA,CO2,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-8.8321,11.2684,-0.085,NA,NA,NA,NA,NA
-benzene,NA,C6H6,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-21.0084,22.934,-1.101,NA,NA,NA,NA,NA
-HCl,NA,HCl,aq,AD03.1,NA,20.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,11.642,-7.4244,-0.28,NA,NA,NA,NA,NA
-Ne,NA,Ne,aq,AD03.2,NA,21.Feb.19,cal,4565,NA,16.74,NA,20.4,1.0014,4.7976,0.5084,NA,NA,NA,NA,NA
-ethylene,NA,C2H4,aq,AD03.2,NA,21.Feb.19,cal,19450,NA,28.7,NA,45.5,-16.8037,18.846,-0.4499,NA,NA,NA,NA,NA
-ethane,NA,C2H6,aq,AD03.2,NA,21.Feb.19,cal,-4141,NA,26.75,NA,51.2,-16.3482,20.0628,-0.6091,NA,NA,NA,NA,NA
-propane,NA,C3H8,aq,AD03.2,NA,21.Feb.19,cal,-2021,NA,33.49,NA,67,-25.3879,28.2616,-1.1471,NA,NA,NA,NA,NA
-butane,NA,C4H10,aq,AD03.2,NA,21.Feb.19,cal,99,NA,39.66,NA,82.8,-33.8492,36.1457,-1.6849,NA,NA,NA,NA,NA
-benzene,NA,C6H6,aq,AD03.2,NA,21.Feb.19,cal,32000,NA,35.62,NA,83.5,-39.109,37.5421,-1.9046,NA,NA,NA,NA,NA
-HF,NA,HF,aq,AD03.2,NA,21.Feb.19,cal,-71662,NA,22.5,NA,12.5,3.0888,-3.5714,0.1008,NA,NA,NA,NA,NA
-SO2,NA,SO2,aq,AD03.2,NA,21.Feb.19,cal,-71980,NA,38.7,NA,38.5,-14.5223,14.3512,-0.4295,NA,NA,NA,NA,NA
-B(OH)3,NA,B(OH)3,aq,AP14,NA,22.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-4.2561,4.0194,-1.057,NA,NA,NA,NA,NA
-Si(OH)4,NA,Si(OH)4,aq,AP14,NA,22.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,0.9285,-0.9409,-1.8933,NA,NA,NA,NA,NA
-As(OH)3,NA,As(OH)3,aq,AP14,NA,22.Feb.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-9.903,7.6818,-1.23,NA,NA,NA,NA,NA
-B(OH)3,NA,B(OH)3,gas,AP14,NA,22.Feb.19,cal,-222523.9,NA,66.589,NA,0,46.7734,-0.097,0.5932,-522.4665,0,0,0,1000
-Si(OH)4,NA,Si(OH)4,gas,AP14,NA,22.Feb.19,cal,-296285.9,NA,82.784,NA,0,22.9685,37.6434,-4.4407,0,-2.7782,7.923E-09,3,1000
-As(OH)3,NA,As(OH)3,gas,AP14,NA,22.Feb.19,cal,-143112.8,NA,73.599,NA,0,22.6338,-16.3623,-3.7213,0,-1.0194,2.7414E-09,3,1000
+Ar,NA,Ar,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-8.5139,11.921,0.0733,NA,NA,NA,NA,NA
+H2S,NA,H2S,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-13.4046,13.8582,-0.2029,NA,NA,NA,NA,NA
+O2,NA,O2,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-9.754,12.9411,0.026,NA,NA,NA,NA,NA
+N2,NA,N2,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-11.538,14.6278,-0.032,NA,NA,NA,NA,NA
+NH3,NA,NH3,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-4.7245,4.9782,-0.0955,NA,NA,NA,NA,NA
+H2,NA,H2,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-8.4596,10.8301,0.309,NA,NA,NA,NA,NA
+CH4,NA,CH4,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-11.8462,14.8615,-0.1131,NA,NA,NA,NA,NA
+CO2,NA,CO2,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-8.8321,11.2684,-0.085,NA,NA,NA,NA,NA
+benzene,NA,C6H6,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-21.0084,22.934,-1.101,NA,NA,NA,NA,NA
+HCl,NA,HCl,aq,AD03.1,NA,2019-02-20,cal,NA,NA,NA,NA,NA,11.642,-7.4244,-0.28,NA,NA,NA,NA,NA
+Ne,NA,Ne,aq,AD03.2,NA,2019-02-21,cal,4565,NA,16.74,NA,20.4,1.0014,4.7976,0.5084,NA,NA,NA,NA,NA
+ethylene,NA,C2H4,aq,AD03.2,NA,2019-02-21,cal,19450,NA,28.7,NA,45.5,-16.8037,18.846,-0.4499,NA,NA,NA,NA,NA
+ethane,NA,C2H6,aq,AD03.2,NA,2019-02-21,cal,-4141,NA,26.75,NA,51.2,-16.3482,20.0628,-0.6091,NA,NA,NA,NA,NA
+propane,NA,C3H8,aq,AD03.2,NA,2019-02-21,cal,-2021,NA,33.49,NA,67,-25.3879,28.2616,-1.1471,NA,NA,NA,NA,NA
+butane,NA,C4H10,aq,AD03.2,NA,2019-02-21,cal,99,NA,39.66,NA,82.8,-33.8492,36.1457,-1.6849,NA,NA,NA,NA,NA
+benzene,NA,C6H6,aq,AD03.2,NA,2019-02-21,cal,32000,NA,35.62,NA,83.5,-39.109,37.5421,-1.9046,NA,NA,NA,NA,NA
+HF,NA,HF,aq,AD03.2,NA,2019-02-21,cal,-71662,NA,22.5,NA,12.5,3.0888,-3.5714,0.1008,NA,NA,NA,NA,NA
+SO2,NA,SO2,aq,AD03.2,NA,2019-02-21,cal,-71980,NA,38.7,NA,38.5,-14.5223,14.3512,-0.4295,NA,NA,NA,NA,NA
+B(OH)3,NA,B(OH)3,aq,AP14,NA,2019-02-22,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-4.2561,4.0194,-1.057,NA,NA,NA,NA,NA
+Si(OH)4,NA,Si(OH)4,aq,AP14,NA,2019-02-22,cal,NA,NA,NA,NA,NA,0.9285,-0.9409,-1.8933,NA,NA,NA,NA,NA
+As(OH)3,NA,As(OH)3,aq,AP14,NA,2019-02-22,cal,NA,NA,NA,NA,NA,-9.903,7.6818,-1.23,NA,NA,NA,NA,NA
+B(OH)3,NA,B(OH)3,gas,AP14,NA,2019-02-22,cal,-222523.9,NA,66.589,NA,0,46.7734,-0.097,0.5932,-522.4665,0,0,0,1000
+Si(OH)4,NA,Si(OH)4,gas,AP14,NA,2019-02-22,cal,-296285.9,NA,82.784,NA,0,22.9685,37.6434,-4.4407,0,-2.7782,7.923E-09,3,1000
+As(OH)3,NA,As(OH)3,gas,AP14,NA,2019-02-22,cal,-143112.8,NA,73.599,NA,0,22.6338,-16.3623,-3.7213,0,-1.0194,2.7414E-09,3,1000
Modified: pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/Berman_cr.csv
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/Berman_cr.csv 2020-08-15 10:28:47 UTC (rev 599)
+++ pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/Berman_cr.csv 2020-08-16 11:09:19 UTC (rev 600)
@@ -1,93 +1,93 @@
name,abbrv,formula,state,ref1,ref2,date,E_units,G,H,S,Cp,V,a1.a,a2.b,a3.c,a4.d,c1.e,c2.f,omega.lambda,z.T
-akermanite,Ak,Ca2MgSi2O7,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-albite,Ab,NaAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"albite,high",hAb,NaAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"albite,low",lAb,NaAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-almandine,Alm,Si3Fe3Al2O12,cr,Ber88,Ber90.1,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-andalusite,And,Al2SiO5,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-anorthite,An,Al2CaSi2O8,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-anthophyllite,Ath,Mg7Si8O24H2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-antigorite,Atg,Mg48Si34O99H62O48,cr,Ber88,BDat17.1,09.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-brucite,Br,MgO2H2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-Ca-Al-pyroxene,CTs,CaAl2SiO6,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-calcite,Cc,CaCO3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-chrysotile,Chr,Mg3Si2O9H4,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-clinochlore,Chl,Mg5Al2Si3O18H8,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-coesite,Cs,SiO2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-cordierite,Cd,Mg2Al4Si5O18,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-corundum,Co,Al2O3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"cristobalite,alpha",aCr,SiO2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"cristobalite,beta",bCr,SiO2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-diaspore,Dsp,AlO2H,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-diopside,Di,MgCaSi2O6,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-dolomite,Do,MgCaC2O6,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"enstatite,clino",cEn,MgSiO3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-enstatite,En,MgSiO3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"enstatite,proto",pEn,MgSiO3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-fayalite,Fa,Fe2SiO4,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-ferrosilite,Fsl,SiFeO3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-forsterite,Fo,Mg2SiO4,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-gehlenite,Ge,Al2Ca2SiO7,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-grossular,Grs,Ca3Al2Si3O12,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-hematite,Hm,Fe2O3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-ilmenite,Ilm,FeTiO3,cr,Ber88,Ber90.1,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-jadeite,Jd,NaAlSi2O6,cr,Ber88,SHD91,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-kaolinite,Kln,Al2Si2O9H4,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-kyanite,Ky,Al2SiO5,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-lawsonite,Lw,CaAl2Si2O10H4,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-lime,Lm,CaO,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-magnesite,Mst,MgCO3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-magnetite,Mt,Fe3O4,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-margarite,Mrg,CaAl4Si2O12H2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-meionite,Me,Ca4Al6Si6O27C,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-merwinite,Mw,Ca3MgSi2O8,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-monticellite,Mo,CaMgSiO4,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-muscovite,Ms,KAl3Si3O12H2,cr,Ber88,SHD91,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-paragonite,Pg,NaAl3Si3O12H2,cr,Ber88,SHD91,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-periclase,Pe,MgO,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-phlogopite,Phl,KMg3AlSi3O12H2,cr,Ber88,SHD91.1,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-K-feldspar,Kfs,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"K-feldspar,high",Sa,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"K-feldspar,low",Mcr,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-prehnite,Prh,Ca2Al2Si3O12H2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-pyrope,Py,Mg3Al2Si3O12,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-pyrophyllite,Prl,Al2Si4O12H2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-quartz,aQz,SiO2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"quartz,beta",bQz,SiO2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-rutile,Rt,TiO2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-sillimanite,Si,Al2SiO5,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-sphene,Sph,CaTiSiO5,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-spinel,Sp,MgAl2O4,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-talc,Tc,Mg3Si4O12H2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-tremolite,Tr,Ca2Mg5Si8O24H2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"tridymite,high",hTr,SiO2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-"tridymite,low",lTr,SiO2,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-wollastonite,Wo,CaSiO3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-pseudowollastonite,pWo,CaSiO3,cr,Ber88,NA,01.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-annite,Ann,Si3Fe3AlKH2O12,cr,Ber90,SHD91.2,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-fluormuscovite,Flms,KAl3Si3O10F2,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-fluorphlogopite,Fphl,KMg3AlSi3O10F2,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-fluorannite,Flan,Si3Fe3AlKO10F2,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-fluortremolite,Fltr,Ca2Mg5Si8O22F2,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-fluorapatite,Flap,Ca5P3O12F,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-hydroxyapatite,Hyap,Ca5P3O13H,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-chlorapatite,Clap,Ca5P3O12Cl,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-fluortalc,Fltc,Mg3Si4O10F2,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-chlorphlogopite,Cphl,KMg3AlSi3O10Cl2,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-chlorannite,Clan,Si3Fe3AlKO10Cl2,cr,ZS92,NA,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-glaucophane,Glc,Na2Al2Mg3Si8O24H2,cr,Eva90,JUN92,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-pumpellyite,Pmp,Ca4Al5MgSi6O28H7,cr,Eva90,JUN92,03.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-aragonite,Arg,CaCO3,cr,FDM+14.1,NA,08.Oct.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-hedenbergite,Hd,CaFeSi2O6,cr,DS10,NA,08.Nov.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-andradite,Adr,Ca3Fe2Si3O12,cr,DS10,NA,08.Nov.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-ferro-actinolite,Fac,Ca2Fe5Si8O22(OH)2,cr,DS10,NA,08.Nov.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-grunerite,Gru,Fe7Si8O22(OH)2,cr,DS10,NA,08.Nov.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-ilvaite,Ilv,CaFe2FeSi2O7O(OH),cr,DS10,NA,08.Nov.17,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-sudoite,Sud,Mg2Al4Si3O10(OH)8,cr,VGT92,NA,06.Mar.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-daphnite,Daph,Fe5Al2Si3O10(OH)8,cr,VPT01,NA,06.Mar.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-Mg-amesite,Mg-Am,Mg4Al4Si2O10(OH)8,cr,VPT01,NA,06.Mar.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-Fe-amesite,Fe-Am,Fe4Al4Si2O10(OH)8,cr,VPV05,NA,06.Mar.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-zoisite,Zo,Ca2Al3Si3O13H,cr,Got04,NA,01.Aug.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-clinozoisite,cZo,Ca2Al3Si3O13H,cr,Got04,NA,01.Aug.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-epidote,Ep,Ca2FeAl2Si3O12(OH),cr,Got04,NA,01.Aug.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
-orthoepidote,oEp,Ca2FeAl2Si3O12(OH),cr,Got04,NA,01.Aug.19,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+akermanite,Ak,Ca2MgSi2O7,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+albite,Ab,NaAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"albite,high",hAb,NaAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"albite,low",lAb,NaAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+almandine,Alm,Si3Fe3Al2O12,cr,Ber88,Ber90.1,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+andalusite,And,Al2SiO5,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+anorthite,An,Al2CaSi2O8,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+anthophyllite,Ath,Mg7Si8O24H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+antigorite,Atg,Mg48Si34O99H62O48,cr,Ber88,BDat17.1,2017-10-09,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+brucite,Br,MgO2H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+Ca-Al-pyroxene,CTs,CaAl2SiO6,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+calcite,Cc,CaCO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+chrysotile,Chr,Mg3Si2O9H4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+clinochlore,Chl,Mg5Al2Si3O18H8,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+coesite,Cs,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+cordierite,Cd,Mg2Al4Si5O18,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+corundum,Co,Al2O3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"cristobalite,alpha",aCr,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"cristobalite,beta",bCr,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+diaspore,Dsp,AlO2H,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+diopside,Di,MgCaSi2O6,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+dolomite,Do,MgCaC2O6,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"enstatite,clino",cEn,MgSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+enstatite,En,MgSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"enstatite,proto",pEn,MgSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+fayalite,Fa,Fe2SiO4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+ferrosilite,Fsl,SiFeO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+forsterite,Fo,Mg2SiO4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+gehlenite,Ge,Al2Ca2SiO7,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+grossular,Grs,Ca3Al2Si3O12,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+hematite,Hm,Fe2O3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+ilmenite,Ilm,FeTiO3,cr,Ber88,Ber90.1,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+jadeite,Jd,NaAlSi2O6,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+kaolinite,Kln,Al2Si2O9H4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+kyanite,Ky,Al2SiO5,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+lawsonite,Lw,CaAl2Si2O10H4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+lime,Lm,CaO,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+magnesite,Mst,MgCO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+magnetite,Mt,Fe3O4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+margarite,Mrg,CaAl4Si2O12H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+meionite,Me,Ca4Al6Si6O27C,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+merwinite,Mw,Ca3MgSi2O8,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+monticellite,Mo,CaMgSiO4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+muscovite,Ms,KAl3Si3O12H2,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+paragonite,Pg,NaAl3Si3O12H2,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+periclase,Pe,MgO,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+phlogopite,Phl,KMg3AlSi3O12H2,cr,Ber88,SHD91.1,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+K-feldspar,Kfs,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"K-feldspar,high",Sa,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"K-feldspar,low",Mcr,KAlSi3O8,cr,Ber88,SHD91,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+prehnite,Prh,Ca2Al2Si3O12H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+pyrope,Py,Mg3Al2Si3O12,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+pyrophyllite,Prl,Al2Si4O12H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+quartz,aQz,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"quartz,beta",bQz,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+rutile,Rt,TiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+sillimanite,Si,Al2SiO5,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+sphene,Sph,CaTiSiO5,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+spinel,Sp,MgAl2O4,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+talc,Tc,Mg3Si4O12H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+tremolite,Tr,Ca2Mg5Si8O24H2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"tridymite,high",hTr,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+"tridymite,low",lTr,SiO2,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+wollastonite,Wo,CaSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+pseudowollastonite,pWo,CaSiO3,cr,Ber88,NA,2017-10-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+annite,Ann,Si3Fe3AlKH2O12,cr,Ber90,SHD91.2,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+fluormuscovite,Flms,KAl3Si3O10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+fluorphlogopite,Fphl,KMg3AlSi3O10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+fluorannite,Flan,Si3Fe3AlKO10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+fluortremolite,Fltr,Ca2Mg5Si8O22F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+fluorapatite,Flap,Ca5P3O12F,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+hydroxyapatite,Hyap,Ca5P3O13H,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+chlorapatite,Clap,Ca5P3O12Cl,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+fluortalc,Fltc,Mg3Si4O10F2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+chlorphlogopite,Cphl,KMg3AlSi3O10Cl2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+chlorannite,Clan,Si3Fe3AlKO10Cl2,cr,ZS92,NA,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+glaucophane,Glc,Na2Al2Mg3Si8O24H2,cr,Eva90,JUN92,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+pumpellyite,Pmp,Ca4Al5MgSi6O28H7,cr,Eva90,JUN92,2017-10-03,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+aragonite,Arg,CaCO3,cr,FDM+14.1,NA,2017-10-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+hedenbergite,Hd,CaFeSi2O6,cr,DS10,NA,2017-11-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+andradite,Adr,Ca3Fe2Si3O12,cr,DS10,NA,2017-11-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+ferro-actinolite,Fac,Ca2Fe5Si8O22(OH)2,cr,DS10,NA,2017-11-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+grunerite,Gru,Fe7Si8O22(OH)2,cr,DS10,NA,2017-11-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+ilvaite,Ilv,CaFe2FeSi2O7O(OH),cr,DS10,NA,2017-11-08,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+sudoite,Sud,Mg2Al4Si3O10(OH)8,cr,VGT92,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+daphnite,Daph,Fe5Al2Si3O10(OH)8,cr,VPT01,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+Mg-amesite,Mg-Am,Mg4Al4Si2O10(OH)8,cr,VPT01,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+Fe-amesite,Fe-Am,Fe4Al4Si2O10(OH)8,cr,VPV05,NA,2019-03-06,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+zoisite,Zo,Ca2Al3Si3O13H,cr,Got04,NA,2019-08-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+clinozoisite,cZo,Ca2Al3Si3O13H,cr,Got04,NA,2019-08-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+epidote,Ep,Ca2FeAl2Si3O12(OH),cr,Got04,NA,2019-08-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
+orthoepidote,oEp,Ca2FeAl2Si3O12(OH),cr,Got04,NA,2019-08-01,cal,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
Modified: pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/DEW.csv
===================================================================
--- pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/DEW.csv 2020-08-15 10:28:47 UTC (rev 599)
+++ pkg/CHNOSZ/inst/extdata/OBIGT/DEW.csv 2020-08-16 11:09:19 UTC (rev 600)
@@ -1,211 +1,211 @@
name,abbrv,formula,state,ref1,ref2,date,E_units,G,H,S,Cp,V,a1.a,a2.b,a3.c,a4.d,c1.e,c2.f,omega.lambda,z.T
-acetate,ACETATE,CH3COO-,aq,Sho95,DEW17.7,26.Sep.17,cal,-88270,-116180,20.6,6.31,40.55,10.018,2.809,6.72,-2.8941,26.3,-3.86,1.3182,-1
-"acetic acid",ACETIC-ACID,CH3COOH,aq,PS01,DEW17.01,26.Sep.17,cal,-94760,-116100,42.7,40.26,51.57,11.5,5.5,1.67,-2.87,44.9,-2.63,-0.076,0
-Ag+,Ag(+),Ag+,aq,SH88,DEW17.2,26.Sep.17,cal,18427,25275,17.54,7.9,-0.8,2.0464,-4.3877,7.0182,-2.5976,12.7863,-1.4254,0.216,1
-AgCl,AgCl(0),AgCl,aq,SSH97,DEW17.6,26.Sep.17,cal,-17450,-18270,34.1,6.7,27,6.7458,2.1396,3.0441,-2.8675,9.7432,-1.6698,-0.038,0
-AgCl2-,AgCl2(-),AgCl2-,aq,SSH97,DEW17.6,26.Sep.17,cal,-51560,-61130,47,7.7,53,12.2533,7.3832,-1.3527,-3.0842,19.1265,-1.4661,0.9169,-1
-Al+3,Al(+3),Al+3,aq,SSWS97,DEW17.05,26.Sep.17,cal,-115609,-126834,-77.7,-31.04,-44.4,-3.3802,-17.0071,14.5185,-2.0758,10.7,-8.06,2.753,3
-AlO2-,AlO2(-),AlO2-,aq,PH95,SHA14.1,26.Sep.17,cal,-198693,-222125,-7.22,-9.55,10,4.298,2.4976,-1.8258,-2.8823,19.1,-6.2,1.7418,-1
-AlO2(SiO2)-,AlO2(SiO2)-,AlO2(SiO2)-,aq,HS19,DEW19.1,30.Jun.20,cal,-403500,-440456,4,32,34.8,9.0313,4.3155,1.2196,-2.9574,39.3711,3.4838,1.5685,-1
-Ar,Ar(0),Ar,aq,SHS89,DEW17.04,26.Sep.17,cal,3900,-2870,14.3,53.35,31.71,6.0003,6.8698,3.0499,-3.063,35.6471,7.316,-0.3073,0
-Au+,Au(+),Au+,aq,SH88,DEW17.2,26.Sep.17,cal,39000,47580,24.5,0.6,11.1,3.3303,0.4233,5.6044,-2.7965,8.1767,-2.9123,0.18,1
-Au+3,Au(+3),Au+3,aq,SH88,DEW17.2,26.Sep.17,cal,103600,96930,-57.9,-36.2,-41.3,-8.0309,-2.3071,13.7983,-2.6836,7.5724,-10.4085,2.4554,3
-Ba+2,Ba(+2),Ba+2,aq,SH88,DEW17.2,26.Sep.17,cal,-134030,-128500,2.3,-12.29,-12.6,1.1011,-8.7609,8.1491,-2.4168,8.0413,-5.5371,0.985,2
-BaCl+,BaCl(+),BaCl+,aq,SSH97,DEW17.5,26.Sep.17,cal,-164730,-165770,22.5,6.18,16.8,4.8851,0.368,4.5296,-2.7942,11.7469,-1.7758,0.2126,1
-Be+2,Be(+2),Be+2,aq,SH88,DEW17.2,26.Sep.17,cal,-83500,-91500,-55.7,-1.3,-25.4,-1.4187,-9.4791,9.9786,-2.3871,22.9154,-3.2995,1.9007,2
-benzene,BENZENE,C6H6,aq,PS01,DEW17.3,26.Sep.17,cal,32000,12230,35.7,89.12,83,17.5199,12.3976,-5.5571,-3.2915,66.9,9.8,-0.25,0
-"bG,NaCl",extended_term_parameter,Z0,aq,OH90,DEW19,30.Jun.20,cal,175,NA,22,12.72,1.83,0.3006,-2.0255,-2.9092,2.0302,-1.5,5.33,-0.368,0
-BO(OH),BO(OH)(0),BO(OH),aq,SH88,SHA14.2,26.Sep.17,cal,-174854,-188505,24,3.76,20.49,5.54,1.38,3.1,-2.84,25,-10,0.1,0
-BO2-,BO2(-),BO2-,aq,SH88,SHA14.4,26.Sep.17,cal,-162240,-184600,-8.9,-9,-16.02,-0.855,-2.596,3.7,-2.6717,17.102,-4.8679,1.7595,-1
-Ca(HCO3)+,Ca(HCO3)(+),Ca(HCO3)+,aq,HS19,DEW19.1,30.Jun.20,cal,-273830,-294350,26,51,30,7.4225,2.7838,2.5039,-2.8941,37.511,7.3541,0.158,1
-Ca(HCOO)+,Ca(HCOO)+,Ca(HCOO)+,aq,HS19,DEW19.1,30.Jun.20,cal,-217930,-232236,11,68,17.5,5.1038,0.5762,4.355,-2.8028,49.5668,10.817,0.3851,1
-Ca(HSiO3)+,Ca(HSiO3)+,Ca(HSiO3)+,aq,HS19,DEW19.1,30.Jun.20,cal,-376299,-397525,16.8,72,36,8.6546,3.9569,1.5203,-2.9426,51.1018,11.6318,0.2973,1
-CaOH+,Ca(OH)(+),Ca(OH)+,aq,SSWS97,DEW17.3,26.Sep.17,cal,-171300,-179600,6.7,1.4,1.9,2.1051,-2.2789,6.749,-2.6848,11.1292,-2.7494,0.4496,1
-Ca+2,Ca+2,Ca+2,aq,FDM+14,DEW19.5,30.Jun.20,cal,-132120,-129800,-13.5,-7.51,-18.45,-0.245,-7.252,5,-2.48,9,-2.52,1.2366,2
-CaCl+,CaCl(+),CaCl+,aq,SSH97,DEW17.5,26.Sep.17,cal,-163100,-168607,4.5,17.5,11.3,3.9392,-0.5326,5.2847,-2.757,20.7297,0.5302,0.4675,1
-CaCl2,CaCl(0),CaCl,aq,SSH97,DEW17.5,26.Sep.17,cal,-194000,-211060,6,29.77,33.3,7.9694,3.3045,2.0673,-2.9156,23.2636,3.0296,-0.038,0
-CaCO3,CaCO3(0),CaCO3,aq,FDM+14,DEW17.03,26.Sep.17,cal,-262750,-287390,0,14.01,21.53,6.66,2.05,3.12,-2.86,32.8,-0.18,2,0
-CaOH+,CaO,CaO,aq,HS19,DEW19.3,30.Jun.20,cal,-152800,NA,16,12,5.5,2.5406,-1.8642,6.4013,-2.7019,12.2781,-0.5902,-0.1,0
-CaSO4,CaSO4(0),CaSO4,aq,SSWS97,DEW17.10,26.Sep.17,cal,-312930,-345900,5,-25,4.7,2.415,-1.9839,6.5015,-2.697,-8.835,-8.1271,-0.038,0
-Cd+2,Cd(+2),Cd+2,aq,SH88,DEW17.2,26.Sep.17,cal,-18560,-18140,-17.4,-3.5,-15.6,0.542,-8.9202,8.5551,-2.4102,15.6572,-3.7476,1.2528,2
-Ce+3,Ce(+3),Ce+3,aq,SH88,DEW17.2,26.Sep.17,cal,-161600,-167400,-49,-38.6,-39.8,-7.6866,-2.5596,13.5864,-2.6732,4.0444,-10.8973,2.2251,3
-Ce+4,Ce(+4),Ce+4,aq,SH88,DEW17.2,26.Sep.17,cal,-121300,-137700,-100.1,0.1,-53.3,-15.6355,11.3069,17.61,-3.2464,40.2794,-3.0143,3.6964,4
-CN-,CN(-),CN-,aq,SH88,DEW17.2,26.Sep.17,cal,41200,36000,22.5,-32.7,24.2,5.0522,6.8757,3.7084,-3.0632,-1.1133,-9.6957,1.29,-1
-CO,CO(0),CO,aq,SM93,DEW17.3,26.Sep.17,cal,-28682,-28910,24.53,64.5,33.8,7.9065,3.2446,2.1175,-2.9131,40.545,10.1041,-0.3715,0
[TRUNCATED]
To get the complete diff run:
svnlook diff /svnroot/chnosz -r 600
More information about the CHNOSZ-commits
mailing list