<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
p.msonormal0, li.msonormal0, div.msonormal0
        {mso-style-name:msonormal;
        mso-margin-top-alt:auto;
        margin-right:0cm;
        mso-margin-bottom-alt:auto;
        margin-left:0cm;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
span.EmailStyle18
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:#1F497D;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:70.85pt 70.85pt 70.85pt 70.85pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="FR-CH" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US">Dear Luis,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US">We have added an argument ‘count’ to the seqtrate function. Setting count = TRUE, you get the counts of the transitions instead of the transition probabilities. For example,
 you get the counts in your case with<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US">seqtrate(i1, count=TRUE)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US">This new version of seqtrate is available with the latest development version (build 2018.08.06) available on R-Forge
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US"><a href="https://r-forge.r-project.org/R/?group_id=743">https://r-forge.r-project.org/R/?group_id=743</a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US">and will be made available on the CRAN within the next weeks.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US">All the best.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US">Gilbert<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<div style="border:none;border-left:solid blue 1.5pt;padding:0cm 0cm 0cm 4.0pt">
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US">From:</span></b><span lang="EN-US"> traminer-users-bounces@lists.r-forge.r-project.org [mailto:traminer-users-bounces@lists.r-forge.r-project.org]
<b>On Behalf Of </b>Luis Fernando García<br>
<b>Sent:</b> samedi 5 août 2017 21:22<br>
<b>To:</b> traminer-users@lists.r-forge.r-project.org<br>
<b>Subject:</b> [Traminer-users] Count instead of frequency matrix<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Dear TramineR users,<o:p></o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">I am new at the list and currently I am trying to obtain a count matrix from several observations. <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">I could do it for a frequency matrix using the seqtrate function. I wanted to know if there exists a similar command which makes the same but computes a count matrix instead. <o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Finally I wanted to know if the package counts with some function to compare two transitions matrices by using a Chi-square test.<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">Thanks!<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">The code goes below!<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">################################################################<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">library(TraMineR)<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z14=c("o-p-m-q-a-q-c-z-a-z-m-z-c-z-e-q-c-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z349=c("o-m-a-c-m-z-m-z-a-c-e-q-c-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z5=c("a-o-p-m-a-q-e-q-a-q-a-z-o-p-m-a-e-a-q-e-q-c-a-c-a-c-o-a-p-m-a-e-q-c-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z12=c("o-p-m-a-e-q-c-a-c-a-q-a-q-e-c-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z17=c("o-c-m-o-m-a-q-e-a-m-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z19=c("o-m-a-q-o-m-q-c-m-z-m-a-q-o-q-a-q-o-a-m-z-a-q-c-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z1=c("p-m-a-o-m-z-e-q-o-p-m-z-p-q-e-z-m-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z10=c("o-p-m-z-a-q-c-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z2=c("o-z-o-m-o-m-a-c-p-a-e-q-a-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z5=c("o-m-o-m-a-e-q-c-z-m-z-o-z-o-m-a-q-c-o-z-o-a-o-p-m-a-q-c-q-c-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z6=c("p-m-a-q-e-q-a-o-p-m-a-q-c-z-m-z-m-z-e-q-c-z-m-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z8=c("o-m-a-q-c-z-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">z9=c("c-p-m-a-e-a-c-a-q-p-m-a-z-a-q-e-q-e-q-e-o-m-z-m-z-m-x")<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">i1    <- seqdef(c(z14,z349,z5,z12,z17,z19,z1,z10,z2,z5,z6,z8,z9))<o:p></o:p></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">seqtrate(i1)<o:p></o:p></p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>