<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7654.12">
<TITLE>FW: seqrplot: Error in plot.new() : figure margins too large</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>I appreciate the explanations-they have been helpful.<BR>
<BR>
I have one more question regarding options for the seqfplot commands. Is it possible to compare the graphs by another variable such as gender?<BR>
Or alternatively with a simple [table] command so that I can determine how many fall into each cluster?<BR>
<BR>
For example:<BR>
table(cluster6, female)<BR>
<BR>
yields: Error in table&nbsp; : object 'female' not found<BR>
which I understand to be because 'female' is in my larger data set but not my sequence data set?<BR>
<BR>
Again, many thanks for your help!<BR>
<BR>
Regards,<BR>
Jane<BR>
<BR>
------------------------------<BR>
<BR>
Date: Thu, 10 Mar 2011 10:19:35 +0100<BR>
From: Matthias Studer &lt;Matthias.Studer@unige.ch&gt;<BR>
Subject: Re: [Traminer-users] seqrplot: Error in plot.new() : figure<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; margins too&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; large<BR>
To: Users questions &lt;traminer-users@r-forge.wu-wien.ac.at&gt;<BR>
Message-ID: &lt;4D7897A7.9060608@unige.ch&gt;<BR>
Content-Type: text/plain; charset=&quot;windows-1252&quot;; Format=&quot;flowed&quot;<BR>
<BR>
Dear Jane,<BR>
<BR>
The problems is that the margins of your plot are too large and that<BR>
there is not enough space to plot it (and to plot what is inside the<BR>
margins). This error appears sometimes on windows if your plot window is<BR>
too small. You may try to maximize it before plotting. Another solution<BR>
would be to plot into a pdf with an appropriate size (maybe try several<BR>
values of width and height)<BR>
<BR>
pdf(file=&quot;myplot.pdf&quot;, width=20, height=20)<BR>
seqmtplot(Org.seq, group=co.fac)<BR>
dev.off()<BR>
<BR>
Finally, another solution would be to reduce the margins using the &quot;par&quot;<BR>
command (see the help of &quot;par&quot; for more details) for instance:<BR>
<BR>
par(mar = c(1,1,1,1))<BR>
seqmtplot(Org.seq, group=co.fac)<BR>
<BR>
Let us know if it fixed your problem.<BR>
All the best,<BR>
<BR>
Matthias Studer<BR>
<BR>
Le 09.03.2011 16:27, Alexis Gabadinho a ?crit :<BR>
&gt; Dear Jane,<BR>
&gt;<BR>
&gt; I tried to reproduce the problem by creating an artificial sequence<BR>
&gt; data set and a clustering variable with the same characteristics as yours:<BR>
&gt;<BR>
&gt; library(TraMineR)<BR>
&gt;<BR>
&gt; co.fac &lt;- rep(paste(&quot;Gr&quot;,1:8, sep=&quot;&quot;), 500)<BR>
&gt; ex &lt;- seqgen(4000, 120, 1:10)<BR>
&gt; Org.seq &lt;- seqdef(ex)<BR>
&gt;<BR>
&gt; ## mean time plot<BR>
&gt; seqmtplot(Org.seq, group=co.fac)<BR>
&gt;<BR>
&gt; The code above works perfectly both on Linux (R 2.10) and Windows (R<BR>
&gt; 2.12). You can try it on your computer. If you get an error with this<BR>
&gt; code, could you tell me which R and TraMineR versions you use ?<BR>
&gt;<BR>
&gt; Moreover I see an error in your &quot;seqrplot&quot; code :<BR>
&gt;<BR>
&gt; seqrplot(Org.seq, group = co.fac, co.fac, border=NA)<BR>
&gt;<BR>
&gt; You have to provide a distance matrix (created with &quot;seqdist()&quot;) for<BR>
&gt; plotting representative sequences, and instead you pass &quot;co.fac&quot;<BR>
&gt; again. Your code should look like this (replace &quot;my.dist.matrix&quot; by<BR>
&gt; the name of your distance matrix):<BR>
&gt;<BR>
&gt; seqrplot(Org.seq, group = co.fac, dist.matrix= my.dist.matrix , border=NA)<BR>
&gt;<BR>
&gt; Sometimes, if a graphic window is open and an error occurs with the<BR>
&gt; plotting function, you have to close the graphic window before running<BR>
&gt; the corrected code again.<BR>
&gt;<BR>
&gt; Let me know if this is the solution to your problem.<BR>
&gt;<BR>
&gt; Best,<BR>
&gt; Alexis.<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt; Le 08. 03. 11 21:08, Jane K. Ohgami a ?crit :<BR>
&gt;&gt;<BR>
&gt;&gt; I am new to TraMineR and have what is probably a very basic question<BR>
&gt;&gt; regarding plot/graphing commands for cluster analysis.<BR>
&gt;&gt; I am analyzing career transitions and my data set consists of<BR>
&gt;&gt;<BR>
&gt;&gt;&nbsp; [&gt;] 3842 sequences with 10 distinct events/states<BR>
&gt;&gt;&nbsp; [&gt;] 2590 distinct sequences<BR>
&gt;&gt;&nbsp; [&gt;] min/max sequence length: 120/120<BR>
&gt;&gt;<BR>
&gt;&gt; Trying to exercise the following syntax:<BR>
&gt;&gt; seqmtplot(Org.seq, group = co.fac, border=NA) or<BR>
&gt;&gt; seqrplot(Org.seq, group = co.fac, co.fac, border=NA)<BR>
&gt;&gt;<BR>
&gt;&gt; I get the following error message:<BR>
&gt;&gt; &gt;Error in plot.new() : figure margins too large<BR>
&gt;&gt;<BR>
&gt;&gt; I have unsuccessfully tried to adjust for this so would appreciate<BR>
&gt;&gt; any suggestions. Basically I need to figure out how my 8 clusters<BR>
&gt;&gt; break down. Any suggestions/advice would be greatly appreciated.<BR>
&gt;&gt; Thank you!<BR>
&gt;&gt;<BR>
&gt;&gt;<BR>
&gt;&gt; _______________________________________________<BR>
&gt;&gt; Traminer-users mailing list<BR>
&gt;&gt; Traminer-users@lists.r-forge.r-project.org<BR>
&gt;&gt; <A HREF="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/traminer-users">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/traminer-users</A><BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt; _______________________________________________<BR>
&gt; Traminer-users mailing list<BR>
&gt; Traminer-users@lists.r-forge.r-project.org<BR>
&gt; <A HREF="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/traminer-users">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/traminer-users</A><BR>
-------------- next part --------------<BR>
An HTML attachment was scrubbed...<BR>
URL: &lt;<A HREF="http://lists.r-forge.r-project.org/pipermail/traminer-users/attachments/20110310/209c988a/attachment-0001.htm">http://lists.r-forge.r-project.org/pipermail/traminer-users/attachments/20110310/209c988a/attachment-0001.htm</A>&gt;<BR>
<BR>
------------------------------<BR>
<BR>
_______________________________________________<BR>
Traminer-users mailing list<BR>
Traminer-users@lists.r-forge.r-project.org<BR>
<A HREF="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/traminer-users">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/traminer-users</A><BR>
<BR>
<BR>
End of Traminer-users Digest, Vol 8, Issue 3<BR>
********************************************<BR>
<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>