<div dir="ltr"><font face="arial, sans-serif">Hi all, </font><div><font face="arial, sans-serif"><br></font></div><div><p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><font face="arial, sans-serif"><span lang="EN-US" style="">My purpose is to predict the replication terminus for archaea, </span><span lang="EN-US" style="color:rgb(33,37,41)">Thermococcus eurythermalis A501 (</span><span lang="EN-US" style="color:rgb(51,51,51);background:whitesmoke">NZ_CP008887</span><span lang="EN-US" style="color:rgb(33,37,41)">). So I </span><span lang="EN-US" style="">used Oriloc to do the cumulative
GC skew, which showed that the terminus is around at 400kb (lowest value
corresponds to the terminus of replication according to their manual, see
attached fig 1).</span><br></font></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><span lang="EN-US"><font face="arial, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><span lang="EN-US"><font face="arial, sans-serif">However, when I used Ori-Finder2, another software to predict the origin of replication, it told me the replication origin
is  from 425,719 to 426,421 (see attached fig 2), which is very close to
the terminus by Oriloc.</font></span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><font face="arial, sans-serif"><span lang="EN-US">It looks like the origin overlaps with the terminus, I don</span>’<span lang="EN-US">t
think it is reasonable.</span></font></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><span lang="EN-US"><font face="arial, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><span lang="EN-US"><font face="arial, sans-serif">Would you please let me know if my interpretation is correct? Do you
have any suggestions on the prediction of the terminus? Thanks a lot!</font></span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><span lang="EN-US"><font face="arial, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><span lang="EN-US"><font face="arial, sans-serif">Best regards,</font></span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><span lang="EN-US" style=""><font face="arial, sans-serif">Xiaojun</font></span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm"><span lang="EN-US" style=""><font face="tahoma, sans-serif" style=""> </font></span></p></div></div>