hello<div><br></div><div>I'm using SeqinR for Ks calculation of pairwise aligned sequences.</div><div>and I found Kaks_calculator2.0 from 
<a href="http://code.google.com/p/kaks-calculator/">http://code.google.com/p/kaks-calculator/</a>  and re-check the result of SeqinR</div><div>However the results were quite different even though I supplied the same reversed aligned sequences.</div>
<div>I noted the SeqinR applied LWL85 model for calculation and I also implemented LWL model in 
Kaks_calculator2.0. </div><div>Anybody experienced same problem? </div><div><br></div><div>Thank you<br clear="all"><div><br></div>-- <br>Kang, Yang Jae<br><br>Cropgenomics Lab. <br>Seoul National Univ.<br>Korea<br>
</div>