<div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Actually, the flags are most likely to be found in mkoctfile config.<br></div>Currently I use the flags returned by:<br></div><br>mkoctfile -p INCFLAGS<br><br></div>Might be easier if you could look if those effectively appear in this variable or any other (do mkoctfile --help to list all variables). They have to come from somewhere...<br>
</div>Thanks.<br><br></div>Renaud<br><div><div><br></div></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On 3 March 2014 10:05, Renaud Gaujoux <span dir="ltr"><<a href="mailto:renaud@mancala.cbio.uct.ac.za" target="_blank">renaud@mancala.cbio.uct.ac.za</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Good.<br></div>The MPI issue seems to be due to some compilation flags not being carried over when compiling RcppOctave library. <br>
</div>The MPI specific flags "-I/usr/include/mpi -DMPICH_SKIP_MPICXX -DOMPI_SKIP_MPICXX" are correctly used when compiling the Octave modules, so these flags should be available from octave-config.<br>
Will look into it later.<br></div>Thanks.<br><br></div>Bests,<br></div>Renaud<br><div><div><div><br><br><br></div></div></div></div>
</blockquote></div><br></div>