<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Hi all, <div><br></div><div>Could anyone please advice what is going on in the following error and how can I fix it?</div><div><br></div><div><div><font color="#e06666">sourceCpp("/Users/fatimabatool/documents/New/Rcodes/trial.cpp") </font></div><div><font color="#e06666">clang++ -std=gnu++11 -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG   -I"/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/Rcpp/include" -I"/Users/fatimabatool/Documents/New/Rcodes" -isysroot /Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk -I/usr/local/include  -fPIC  -Wall -g -O2  -c trial.cpp -o trial.o</font></div><div><font color="#e06666">Error in sourceCpp("/Users/fatimabatool/documents/New/Rcodes/trial.cpp") : </font></div><div><font color="#e06666">  Error 1 occurred building shared library.</font></div><div><font color="#e06666">clang: warning: no such sysroot directory: '/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk' [-Wmissing-sysroot]</font></div><div><font color="#e06666">In file included from trial.cpp:9:</font></div><div><font color="#e06666">In file included from /Users/fatimabatool/Documents/New/Rcodes/trial.hpp:12:</font></div><div><font color="#e06666">/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../include/c++/v1/stdio.h:108:15: fatal error: 'stdio.h' file not found</font></div><div><font color="#e06666">#include_next <stdio.h></font></div><div><font color="#e06666">              ^~~~~~~~~</font></div><div><font color="#e06666">1 error generated.</font></div><div><font color="#e06666">make: *** [trial.o] Error 1</font></div></div><div><font color="#e06666"><br></font></div><div><font color="#e06666"><br></font></div><div><font color="#000000">I was able to source all .cpp files before system updates. I have recently updated my MacOS to Catalina (10.15.2) and using Xcode 11.3. I am working in R </font>Action of the Toe. Using version 1.0.3 of Rcpp. I have clang version 4.0.1. </div><div><br></div><div>I have Library/Developer but no ../CommandLineTools/SDKs/MAcOSX.sdk subdirectories exist there. </div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>Best wishes, </div><div>Fatima</div></div></div></div></div>