[Pomp-commits] r1229 - in pkg/pomp: . data inst/examples man

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Thu Jun 25 23:09:31 CEST 2015


Author: kingaa
Date: 2015-06-25 23:09:31 +0200 (Thu, 25 Jun 2015)
New Revision: 1229

Added:
   pkg/pomp/data/ewmeas.csv
   pkg/pomp/man/measles.Rd
Removed:
   pkg/pomp/inst/examples/ewmeas.csv
   pkg/pomp/man/LondonYorke.Rd
Modified:
   pkg/pomp/DESCRIPTION
Log:
- add in and document E&W measles data (courtesy of Ben Bolker)

Modified: pkg/pomp/DESCRIPTION
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+++ pkg/pomp/DESCRIPTION	2015-06-25 21:09:31 UTC (rev 1229)
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 Package: pomp
 Type: Package
 Title: Statistical Inference for Partially Observed Markov Processes
-Version: 0.68-4
-Date: 2015-06-18
+Version: 0.69-1
+Date: 2015-06-25
 Authors at R: c(person(given=c("Aaron","A."),family="King",
 		role=c("aut","cre"),email="kingaa at umich.edu"),
 	  person(given=c("Edward","L."),family="Ionides",role=c("aut")),

Copied: pkg/pomp/data/ewmeas.csv (from rev 1228, pkg/pomp/inst/examples/ewmeas.csv)
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--- pkg/pomp/data/ewmeas.csv	                        (rev 0)
+++ pkg/pomp/data/ewmeas.csv	2015-06-25 21:09:31 UTC (rev 1229)
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Deleted: pkg/pomp/man/LondonYorke.Rd
===================================================================
--- pkg/pomp/man/LondonYorke.Rd	2015-06-25 12:16:37 UTC (rev 1228)
+++ pkg/pomp/man/LondonYorke.Rd	2015-06-25 21:09:31 UTC (rev 1229)
@@ -1,38 +0,0 @@
-\name{LondonYorke}
-\alias{LondonYorke}
-\docType{data}
-\title{Historical childhood disease incidence data}
-\description{
-  \code{LondonYorke} is a data-frame containing the monthly number of reported cases of chickenpox, measles, and mumps from two American cities (Baltimore and New York) in the mid-20th century (1928--1972).
-}
-\usage{
-LondonYorke
-}
-\examples{
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-lines(cases~time,data=LondonYorke,subset=disease=="measles"&town=="New York",col="blue")
-legend("topright",legend=c("Baltimore","New York"),lty=1,col=c("red","blue"),bty='n')
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-plot(
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-     data=LondonYorke,
-     subset=disease=="mumps"&town=="New York",
-     type='l',col="blue",main="mumps, New York",
-     bty='l'
-    )
-}
-\references{
-  W. P. London and J. A. Yorke,
-  Recurrent Outbreaks of Measles, Chickenpox and Mumps: I. Seasonal Variation in Contact Rates,
-  American Journal of Epidemiology, 98:453--468, 1973.
-  }
-\keyword{datasets}

Copied: pkg/pomp/man/measles.Rd (from rev 1228, pkg/pomp/man/LondonYorke.Rd)
[TRUNCATED]

To get the complete diff run:
    svnlook diff /svnroot/pomp -r 1229


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