<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7653.38">
<TITLE>RE: [Phylobase-devl] stalled ...</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Hi list,<BR>
<BR>
though I have been out for a while, and therefore disconnected from all current concerns, I have found (with the help of Ben) some dumb task that needed attention.<BR>
<BR>
I renamed functions in phylobase (just in /pkg, not in branches) as follows:<BR>
from&nbsp; -&gt;&nbsp; to<BR>
attach_data&nbsp;&nbsp;&nbsp; attachData<BR>
check_data&nbsp;&nbsp;&nbsp; checkData<BR>
check_phylo4&nbsp;&nbsp;&nbsp; checkPhylo4<BR>
check_tree&nbsp;&nbsp;&nbsp; checkTree<BR>
getedges&nbsp;&nbsp;&nbsp; getEdge<BR>
hasSingles&nbsp;&nbsp;&nbsp; hasSingle<BR>
<BR>
There are other items in the tracker submitted by Ben:<BR>
<A HREF="http://r-forge.r-project.org/tracker/index.php?func=detail&aid=275&group_id=111&atid=491">http://r-forge.r-project.org/tracker/index.php?func=detail&aid=275&group_id=111&atid=491</A><BR>
<BR>
As François, I prefer nNodes, nTips and nEdges to stay plurial, so I leaved these as they were. Same thing for all 'labels' stuff (e.g. hasNodeLabels).<BR>
<BR>
If there are other renaming to do, please let me know.<BR>
<BR>
Best,<BR>
<BR>
Thibaut.<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>