<div dir="ltr"><div>Hi,<br><br></div><div>this code is executed when querying the number of available cores on the machine.<br>It uses the result from `parallel::detectCores(all.tests = isOpenBSD)`, where `isOpenBSD=TRUE` on Open BSD hosts.<br></div><div>Can you please submit an issue on Github for this?<br></div><div>Thanks.<br><br></div><div>Bests,<br></div><div>Renaud<br><br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div><font size="2"><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Renaud Gaujoux, PhD<br></span></font></div><font size="2"><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Systems Immunology - Technion, Haifa, Israel<br></span></font></div><font size="2"><span style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"></span></font><div><font size="2"><br></font></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On 30 November 2016 at 15:39, Roel Janssen <span dir="ltr"><<a href="mailto:roel@gnu.org" target="_blank">roel@gnu.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hello there.<br>
<br>
First of all, thanks for creating this package.  It's really useful.<br>
I've been trying to confine run-time environments in a container (so the<br>
program only has access to a subset of the operating system).<br>
<br>
When loading NMF from inside a container, it fails and I don't know what<br>
I'm missing.  Here's the output from inside the container:<br>
<br>
------------------------------<wbr>---- BEGIN ------------------------------<wbr>----<br>
user@container ~# R<br>
<br>
R version 3.3.1 (2016-06-21) -- "Bug in Your Hair"<br>
Copyright (C) 2016 The R Foundation for Statistical Computing<br>
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)<br>
<br>
R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.<br>
You are welcome to redistribute it under certain conditions.<br>
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.<br>
<br>
R is a collaborative project with many contributors.<br>
Type 'contributors()' for more information and<br>
'citation()' on how to cite R or R packages in publications.<br>
<br>
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or<br>
'help.start()' for an HTML browser interface to help.<br>
Type 'q()' to quit R.<br>
<br>
> library(NMF)<br>
Loading required package: pkgmaker<br>
Loading required package: registry<br>
<br>
Attaching package: 'pkgmaker'<br>
<br>
The following object is masked from 'package:base':<br>
<br>
    isNamespaceLoaded<br>
<br>
Loading required package: rngtools<br>
Loading required package: cluster<br>
sh: wc: command not found<br>
Error : .onAttach failed in attachNamespace() for 'NMF', details:<br>
  call: if (n > 2) n <- n - 1L<br>
  error: missing value where TRUE/FALSE needed<br>
Error: package or namespace load failed for 'NMF'<br>
><br>
------------------------------<wbr>----- END ------------------------------<wbr>-----<br>
<br>
I couldn't find 'if (n > 2) n <- n - 1L' in the source code, so I am<br>
clueless on what goes wrong here.<br>
<br>
Any ideas?<br>
<br>
Kind regards,<br>
Roel Janssen<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
nmf-user mailing list<br>
<a href="mailto:nmf-user@lists.r-forge.r-project.org">nmf-user@lists.r-forge.r-<wbr>project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/nmf-user" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.r-forge.r-<wbr>project.org/cgi-bin/mailman/<wbr>listinfo/nmf-user</a><br>
<br>
</blockquote></div><br></div>