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<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>

</head>

<body ocsi="0" fpstyle="1">

<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Hi All,<br>

<br>

I am in the process of finishing the first USER usable version of omicabelnomm and would need help converting real data from impute2 to databel.<br>

<br>

The function impute2databel seems ok but I have no idea if it stores in FLOAT or DOUBLE the values.

<br>

<br>

I found this on the mailing list, would it work?<br>

<br>

<pre>><i> owd<- setwd(pth)

</i>><i> fls<- list.files(pattern="^chr")

</i>><i> ufls<- unique(sapply(strsplit(fls, "_"), "[", 1))

</i>><i> for(i in ufls){

</i>><i>       of<- strsplit(i, "\\.")[[1]]

</i>><i>       of<- paste(of[1], tail(of, 1), sep=".")

</i>><i>       impute2databel(genofile = i,

</i>><i>                      samplefile = paste(i, "info", sep="_"),

</i>><i>                      outfile = of,

</i>><i>                      makeprob=TRUE, old=FALSE)

</i>><i> }

</i>><i> setwd(owd)<br><br>Best,<br><br>Alvaro<br></i></pre>

<br>

</div>

</body>

</html>