<html>

  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  </head>

  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">

    In this email, I propose a new approach which allows to reduce total

    size of data from 8Mb to 2Mb that reduce the entire GenABEL size

    from 12Mb to 6Mb. <br>

    <br>

    "R CMD check --as-cran" reports that the following sub-directories

    have too big size: data (2.3Mb), exdata (5.7Mb) and libs (2.6Mb).

    After the last GenABEL submission to CRAN, the maintainers suggested

    to create a new package called GenABELdata and move all the data

    there. I run through the data and found that:<br>

    1) "exdata" directory can be compressed by gzip and reduced from

    5.8Mb -> 1.1Mb. <br>

        - There is a function guzip() from library R.utils which can

    decompress the files. It works on any OS. <br>

        - Moreover: the native R function read.table() can read gzip

    files without decompression.<br>

        - Even more: it looks like that the biggest file "srgenos.dat"

    is used only once a long time ago for generating "srdta.RData" and

    now it is just sitting there and eating space needlessly.<br>

    2) We can delete some files from the "data" directory. The deleted

    files will be generated on the user computer based on the files from

    exdata. It can be done during INSTALLATION (a line in Makefile?) or

    on the first load through (<code>run funcion .onAttach() in R/zzz.R</code>).

    It will reduce total size of "data" directory from 2.3Mb to 800Kb.<br>

    <br>

    Any objections/suggestions?<br>

    <br>

    best,<br>

    Maksim<br>

  </body>

</html>