<div dir="ltr">Thank you, Xia, for submitting this bug report!<div><br></div><div>Y</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Nov 7, 2013 at 3:49 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:genabel-bugs@r-forge.r-project.org" target="_blank">genabel-bugs@r-forge.r-project.org</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Bugs item #5065, was opened at 2013-11-07 15:49 by Xia Shen<br>
You can respond by visiting:<br>
<a href="https://r-forge.r-project.org/tracker/?func=detail&atid=2058&aid=5065&group_id=505" target="_blank">https://r-forge.r-project.org/tracker/?func=detail&atid=2058&aid=5065&group_id=505</a><br>

<br>
Status: Open<br>
Priority: 3<br>
Submitted By: Xia Shen (shenxia)<br>
Assigned to: Nobody (None)<br>
Summary: polygenic() runs into numerical error when changing the way of input<br>
Resolution: Awaiting Response<br>
Operating System: Linux (64bit)<br>
Severity: major<br>
Hardware: None<br>
Version: v1.7-6<br>
Component: GenABEL<br>
URL:<br>
<br>
<br>
Initial Comment:<br>
I had:<br>
<br><br></blockquote><div>... </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">   0 -Inf<br>
<br>
Error in nlm(llFUN, p = parsave, y = y, desmat = desmat, relmat = relmat,  :<br>
  non-finite value supplied by 'nlm'<br>
<br>
But:<br>
<br>
<br></blockquote><div>... </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
******************************************<br>
*** GOOD convergence indicated by FGLS ***<br>
******************************************<br>
<br>
Why simply changing the way of input gave different outcome?? By the way,<br>
<br><br></blockquote></div>
</div></div>