<br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 1, 2013 at 4:52 PM, Содбо Шарапов <span dir="ltr"><<a href="mailto:sharapovsodbo@gmail.com" target="_blank">sharapovsodbo@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div>Thank you, Lennart and Yurii=)</div><div class="im"><div><br></div><div>>I've got a similar feature request/bug report for ProbABEL, do you know</div><div>>what the effect of going from unsigned int to int64 will be on memory</div>

<div>>usage?</div><div><br></div></div><div>int64_t use 8 bytes instead of 4 bytes for int. </div><div>In case of "reshuffle", now there are only three int64_t variables. As you can see, there is no problem with size of memory.</div>

<div>But, during "reshuffling" tile_coordinates counting many times (about one time per 5-10 doubles from data).</div><div>So, now reshuffle's runtime for data [1080traits;122756SNP;5 columns] is about 21 sec (this runtime is for --chi=25 opertaion).</div>

<div>Before correction, runtime was about 16 sec...faster than now.</div><div><br></div><div>PS: I found some another bugs in reshuffle(with --heritabilities) and ,also, ways to optimized work with big data. As soon as possible, I'll do it.</div>

</div><div><div class="h5"><div class="gmail_extra"><font face="arial, sans-serif"><br></font></div></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Yep, I noticed that outputs of --heritabilities are a bit strange (some small negatives for parameters which should be positive) :)</div>
<div><br></div><div>keep us posted!</div><div><br></div><div>YA</div></div>