<div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Would it make sense to format your output files to MaCH or Impute format<br>
and then use the regular import functions?<br>
Is your data in binary format or plain text?<br><br></blockquote><div><br></div><div>... or - something which I always recommend and use -- TPED format (e.g. you can export this from PLINK) and then use "convert.snp.tped"</div>
<div><br></div><div>Yurii </div>
</div>