<div dir="ltr"><div><div><div>There is an issue, boring but may be important to agree on now, i.e. labeling of length bins.<br><br></div>What does a length bin mean, i.e. if the "quant" dim represents length? and the values are 5, 10, ...?<br>
<br></div>In the mixdist package these are the righthand boundaries i.e. they represent (0,5] and (5,10]. But if they are the lefthand boundaries then they represent (5,10] and (10,INF]. Or they could be midpoints. One option would be to explicitly label the bins with the boundaries and then have methods for going backwards and forwards between parametric and non-parametric methods. Or to have an attribute that tracks the properties.<br>
<br></div><div>Otherwise I can see a lot of time being wasted in stock assessments. well more than normal.<br></div>Laurie <br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 22, 2013 at 1:07 PM, Ernesto <span dir="ltr"><<a href="mailto:ernesto.jardim@jrc.ec.europa.eu" target="_blank">ernesto.jardim@jrc.ec.europa.eu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="im">On 05/22/2013 12:02 PM, Ernesto wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
On 05/22/2013 11:34 AM, Sarah Kraak wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi FLR-guys,<br>
<br>
As you know I am not an active FLR user, but last year I showed some interest in whether you have size-based stuff in FLR (see attached email). In the meanwhile Coilin Minto and myself have been working on something (also attached - note this is a draft of the idea; at the moment we are working on the code to get the final graphs out) which we are coding in R but which could/should eventually been done in FLR. Perhaps you are interested.<br>

<br>
Cheers,<br>
Sarah<br>
</blockquote>
<br>
Hi,<br>
<br>
Following Laurie's suggestion I've started a git repository for length<br>
methods in FLRhttps://<a href="http://github.com/ejardim/FLMethLen" target="_blank">github.com/ejardim/<u></u>FLMethLen</a><br>
<br>
Maybe our first task should be o write down what we're doing with length<br>
data. Laurie's working on ALKs, so I guess you're interested in<br>
converting length frequencies to ages for stock assessment !? We (a4a)<br>
are working on OMs and how to generate them from length based data so<br>
that uncertainty on the growth model can be included in the MSE. Sarah<br>
and Colin Minto are working on selectivity. What else ?<br>
<br>
Best<br>
<br>
EJ<br>
</blockquote></div>
Hi,<br>
<br>
I've updated the readme to reflect the latest messages.<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
<br>
EJ<br>
<br>
-- <br>
Ernesto Jardim<<a href="mailto:ernesto.jardim@jrc.ec.europa.eu" target="_blank">ernesto.jardim@jrc.ec.<u></u>europa.eu</a>><br>
Fisheries Scientist<br>
FISHREG – Scientific Support to Fisheries<br>
IPSC Maritime Affairs Unit<br>
EC Joint Research Center<br>
TP 051, Via Enrico Fermi 2749<br>
I-21027 Ispra (VA), Italy<br>
Office : <a href="tel:%2B39%200332%20785311" value="+390332785311" target="_blank">+39 0332 785311</a><br>
Fax: <a href="tel:%2B39%200332%20789658" value="+390332789658" target="_blank">+39 0332 789658</a><br>
<a href="https://fishreg.jrc.ec.europa.eu/" target="_blank">https://fishreg.jrc.ec.europa.<u></u>eu/</a><br>
<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
flr-list mailing list<br>
<a href="mailto:flr-list@flr-project.org" target="_blank">flr-list@flr-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/flr-list" target="_blank">https://lists.r-forge.r-<u></u>project.org/cgi-bin/mailman/<u></u>listinfo/flr-list</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>