<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
      Nothing springs to mind.  Latest version v1.8.10 from CRAN right? 
      Or v1.8.11 on R-Forge?<br>
      <br>
      On this bit :<br>
      > So somewhere these key columns think they are different
      lengths than they really are, and<br>
      > when I try to access it I go into memory I shouldn't so I
      segfault.  How can I verify this? Is<br>
      > there something about the DT I can check to see what DT
      thinks these columns are?<br>
      <br>
      .Internal(inspect(DT)) reveals the internal structure including
      length and truelength on the column pointer vector as well as each
      column.<br>
      <br>
      But it's a really odd way of using data.table.  Iterating by row
      is going to kill performance;  data.table likes by column.<br>
      <br>
      If it really has to be by row  then   DT[, fun(.SD,...),
      by=1:nrow(DT)]  should be better than apply().<br>
      <br>
      Matthew<br>
      <br>
      On 10/09/13 18:47, Chris Neff wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:CAAuY0RV7LQHY2E6KQLZif-3-euvojL+VWYYAQGrr08Bn+35b4A@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <div dir="ltr">Narrowing it down further, 
        <div><br>
        </div>
        <div>a$x</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>segfaults and</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>a[,x]</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>segfaults but</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>a[,"x", with=FALSE]</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>doesn't.</div>
      </div>
      <div class="gmail_extra"><br>
        <br>
        <div class="gmail_quote">On Tue, Sep 10, 2013 at 1:32 PM, Chris
          Neff <span dir="ltr"><<a moz-do-not-send="true"
              href="mailto:caneff@gmail.com" target="_blank">caneff@gmail.com</a>></span>
          wrote:<br>
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0
            .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
            <div dir="ltr">I'm pretty sure it is some issue of a column
              that thinks it is bigger than it actually is.  I have
              tried, so far in vain, to make a reproducible example that
              I can share.  I have one, but can't share it.
              <div>
                <br>
              </div>
              <div>What happens is this: </div>
              <div><br>
              </div>
              <div>A data.frame is made:</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>> d = data.frame(...)</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>Then I call apply over every row, calling a different
                function that takes in a DT as well:</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>l = apply(d, 1, function(x) func(x[1], x[2], DT))</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>This returns a data.frame.  If I rbindlist this:</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>a = rbindlist(l)</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>I can print a just fine, and it will show me all data
                like normal. but if I try to just do </div>
              <div><br>
              </div>
              <div>a$x</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>x is one of the columns that was a key in DT, then it
                segfaults.  If I ask for a column that was made by
                "func" and wasn't a column in DT, it works fine.  If I
                ask for only the first 10 rows and then ask for x:</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>a[1:10]$x</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>it works fine.</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>So somewhere these key columns think they are
                different lengths than they really are, and when I try
                to access it I go into memory I shouldn't so I segfault.
                 How can I verify this? Is there something about the DT
                I can check to see what DT thinks these columns are?</div>
              <div><br>
              </div>
              <div><br>
              </div>
              <div>Also, if instead of apply when making the list, I do</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>l = lapply(1:nrow(d), function(i)
                func(x[i,1],x[i,2],DT))</div>
              <div><br>
              </div>
              <div>and rbindlist that, it works fine too.<br>
                <br>
              </div>
            </div>
          </blockquote>
        </div>
        <br>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
datatable-help mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:datatable-help@lists.r-forge.r-project.org">datatable-help@lists.r-forge.r-project.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/datatable-help">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/datatable-help</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>