<div dir="ltr">Hi Steve,<div><br></div><div style>Problem solved! If I go back for more information enough times, I'm bound to start a new R session sooner or later, and that seemed to do the trick.</div><div style><br>

</div><div style>I'm not tech-savvy enough to use SVN. Instead I try to avoid updating software by using as little of it as possible (for R packages: just stringr and data.table).</div><div style><br></div><div style>

Thanks again,</div><div style><br></div><div style>Frank</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jun 27, 2013 at 11:46 AM, Steve Lianoglou <span dir="ltr"><<a href="mailto:lianoglou.steve@gene.com" target="_blank">lianoglou.steve@gene.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Frank,<br>
<div class="im"><br>
On Thu, Jun 27, 2013 at 8:35 AM, Frank Erickson <<a href="mailto:FErickson@psu.edu">FErickson@psu.edu</a>> wrote:<br>
> Hi Steve,<br>
><br>
> Thanks for the suggestion. It doesn't work verbatim; I see<br>
><br>
> ERROR: compilation failed for package 'data.table'<br>
><br>
> and later a warning:<br>
><br>
> 1: running command '"C:/PROGRA~1/R/R-30~1.1/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "U:\R"<br>
> C:\Users\FPERIC~1\AppData\Local\Temp\3\RtmpuWYzPl/downloaded_packages/data.table_1.8.8.tar.gz'<br>
> had status 1<br>
<br>
</div>Hmm -- sorry, this is rather strange and I'm also not well versed in<br>
smoking out windows compilation problems.<br>
<br>
Can you provide more of the installation log so we can see what the<br>
error is, exactly?<br>
<br>
I say it's strange because it seems as if CRAN actually has the<br>
compiled version of the latest version of the package for windows<br>
there:<br>
<br>
<a href="http://cran.r-project.org/web/packages/data.table/index.html" target="_blank">http://cran.r-project.org/web/packages/data.table/index.html</a><br>
<br>
In particular:<br>
<br>
<a href="http://cran.r-project.org/bin/windows/contrib/r-release/data.table_1.8.8.zip" target="_blank">http://cran.r-project.org/bin/windows/contrib/r-release/data.table_1.8.8.zip</a><br>
<br>
Perhaps you might try changing the CRAN mirror you are using to see if<br>
you can grab it? Or just download from the link above and install the<br>
compiled version locally?<br>
<br>
As for me -- I try to keep my version of data.table tied to SVN and<br>
periodically svn up and recompile ... I've had no compilation problems<br>
as of late (I just recompiled now to double check), so I'm not sure<br>
what's going on on your setup.<br>
<br>
Sorry that I can't be of much help here, perhaps some other windows<br>
users can chime in.<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
-steve<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
--<br>
Steve Lianoglou<br>
Computational Biologist<br>
Bioinformatics and Computational Biology<br>
Genentech<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>