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<div class=WordSection1>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Followup:<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>This issues seems to have gone
away when I updated to version 1.5<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Best,<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Damian<o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Damian Betebenner</span><span
style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Center for Assessment</span><span
style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>PO Box 351</span><span
style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Dover, NH 03821-0351</span><span
style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:navy'> <o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Phone (office): (603) 516-7900</span><span
style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Phone (cell): (857) 234-2474</span><span
style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Fax: (603) 516-7910</span><span
style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:navy'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;color:navy'><a
href="mailto:dbetebenner@nciea.org">dbetebenner@nciea.org</a><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;color:navy'><a
href="http://www.nciea.org/">www.nciea.org</a><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;color:navy'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style='border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in'>
<p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'> Damian Betebenner <br>
<b>Sent:</b> Sunday, September 26, 2010 10:22 AM<br>
<b>To:</b> datatable-help@lists.r-forge.r-project.org<br>
<b>Subject:</b> Passing user defined functions as part of the j argument<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>I’m running into scoping issues and instead of doing “trial
and error” for the next several hours, thought I would ask<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>for some help to understand the bigger issue.<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>Within a function I have several functions. Within one of
those functions I call one of the other defined functions using data.table.<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>The issue is that I can’t find the function that I’m calling
as part of the j expression in data.table.<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>Here’s a simple example:<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>require(data.table)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>test.data <- data.table(ID=rep(1:2, each=10),
SCORE=rnorm(20))<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>test.fun <- function(my.data) {<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>my.mean <- function(x) {<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal> mean(x, na.rm=TRUE)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>}<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>my.data[,my.mean(SCORE), by=ID]<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>}<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>> test.fun(test.data)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>Error in eval(expr, envir, enclos) : could not find function
"my.mean"<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>My situation involves calling a function much more
complicated than “my.mean”. So my question is, how can I get access to the
function “my.mean” within data.table.<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>A more realistic example that includes the outer function is
as follows:<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>#1 Try to explicitly pass the function<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>outer.function <- function(ss.data) {<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal> test.data <- as.data.table(ss.data)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal> my.mean <- function(x) {<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>
mean(x, na.rm=TRUE)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal> }<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal> test.fun <- function(my.data, my.function) {<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>
my.data[,my.function(SCORE), by=ID]<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal> }<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal> my.result <- test.fun(test.data, my.mean)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal> return(my.result)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>}<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>outer.function(data.frame(ID=rep(1:2, each=10),
SCORE=rnorm(20)))<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>Error in eval(expr, envir, enclos) : <o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal> could not find function "my.function"<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>#2 Try to see if somehow the function “my.mean” gets found.<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>outer.function <- function(ss.data) {<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal> test.data <- as.data.table(ss.data)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal> my.mean <- function(x) {<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>
mean(x, na.rm=TRUE)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal> }<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal> test.fun <- function(my.data) {<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal> my.data[,my.mean(SCORE),
by=ID]<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal> }<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal> my.result <- test.fun(test.data)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal> return(my.result)<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal>}<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>outer.function(data.frame(ID=rep(1:2, each=10),
SCORE=rnorm(20)))<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>Error in eval(expr, envir, enclos) : could not find function
"my.mean"<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>Any help in better understanding the scoping rules would be
greatly appreciated.<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>Best regards,<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>Damian<o:p></o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal>Damian Betebenner<span style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal>Center for Assessment<span style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal>PO Box 351<span style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal>Dover, NH 03821-0351<span style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:navy'> <o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal>Phone (office): (603) 516-7900<span style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal>Phone (cell): (857) 234-2474<span style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal>Fax: (603) 516-7910<span style='color:navy'><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='color:navy'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;color:navy'><a
href="mailto:dbetebenner@nciea.org">dbetebenner@nciea.org</a><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;color:navy'><a
href="http://www.nciea.org/">www.nciea.org</a><o:p></o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><span style='font-size:10.0pt;color:navy'><o:p> </o:p></span></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
<p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p>
</div>
</body>
</html>