<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi,<br>
    <br>
    I just fix the bug you mentioned in Ensemble.Forecasting.raster.<br>
    <br>
    Cheers,<br>
    <br>
    Damien <br>
    <br>
    <br>
    On 30/05/2012 09:42, Visser, V, Dr <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:vernonvisser@sun.ac.za"><vernonvisser@sun.ac.za></a>
    wrote:
    <blockquote
cite="mid:63F358F0ED08BD40AADA9D735420310F033163017A60@STBEVS08.stb.sun.ac.za"
      type="cite">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=ISO-8859-1">
      <meta name="Generator" content="Microsoft Word 14 (filtered
        medium)">
      <style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:"Lucida Console";
        panose-1:2 11 6 9 4 5 4 2 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        mso-fareast-language:EN-US;}
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pre
        {mso-style-priority:99;
        mso-style-link:"HTML Preformatted Char";
        margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:10.0pt;
        font-family:"Courier New";}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
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span.HTMLPreformattedChar
        {mso-style-name:"HTML Preformatted Char";
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        mso-fareast-language:EN-ZA;}
.MsoChpDefault
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<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
      <div class="WordSection1">
        <p class="MsoNormal">I am trying to use the
          Ensemble.Forecasting.raster function, but get the following
          error:<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><span
            style="font-size:10.0pt;font-family:"Lucida
            Console";color:black;mso-fareast-language:EN-ZA">Error
            in out[["thresholds"]][, (j - 1) * nbrep + k] <-
            c(ths[[1]][length(ths[[1]])],  : <o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span
            style="font-size:10.0pt;font-family:"Lucida
            Console";color:black;mso-fareast-language:EN-ZA">  number
            of items to replace is not a multiple of replacement length<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">I used a cropped raster stack
          (predictors_sub) to do the model projections (with
          Projection.Raster). My code looks like the following:<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Models(GAM = T,Spline = 4,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">         NbRunEval = 4,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">         DataSplit = 70,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">         NbRepPA=2,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">         strategy="random",<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">         coor=alldata2[,12:13],<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">         nb.absences=10000,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">         Roc = T,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">         VarImport=T<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">         )<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Projection.raster(RasterProj=predictors_sub,
          GAM=T, Proj.name="Proj.clunum")<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Ensemble.Forecasting.raster(Proj.name="Proj.clunum",GAM=T,
          weight.method='Roc')<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">I tried using traceback to find the error,
          but all it says is the following:<o:p></o:p></p>
        <pre><span style="font-family:"Lucida Console";color:black">1: Ensemble.Forecasting.raster(Proj.name = "Proj.clunum", GAM = T, <o:p></o:p></span></pre>
        <pre><span style="font-family:"Lucida Console";color:black">       weight.method = "Roc")<o:p></o:p></span></pre>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Any help would be most appreciated.<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Thanks,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-family:"Arial","sans-serif";color:gray;mso-fareast-language:EN-ZA">Vernon
            Visser<br>
            Post-doctoral Research Associate<br>
            Centre of Excellence for Invasion Biology<br>
            Department of Botany and Zoology<br>
            Natural Sciences Building<br>
            Private Bag X1<br>
            University of Stellenbosch<br>
            Matieland <br>
            7602<br>
            South Africa<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-family:"Arial","sans-serif";mso-fareast-language:EN-ZA"><a
              moz-do-not-send="true"
              href="https://sites.google.com/site/vernonvisserpostdoc/"><span
                style="color:blue">https://sites.google.com/site/vernonvisserpostdoc/</span></a></span><span
            style="mso-fareast-language:EN-ZA"><o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Biomod-commits mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org">Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>