
<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><blockquote type="cite"><div><div>> Ensemble.Forecasting(Proj.name="cccm80a2a", weight.method='Roc', PCA.media=F, binary=T, bin.method='Roc', Test=T, decay="proportional", repetition.models=T, final.model.out=TRUE)</div><div><div>> Ensemble.Forecasting(Proj.name="had80a2a", weight.method='Roc', PCA.media=F, binary=T, bin.method='Roc', Test=T, decay="proportional", repetition.models=T, final.model.out=TRUE)</div></div><div><br></div><div><div>> load("proj.cccm80a2a/Total_consensus_cccm80a2a_Bin")</div><div>> load("proj.had80a2a/Total_consensus_had80a2a_Bin")</div></div></div></blockquote><div><br></div><div>You should not work with the Bin but rather with the probability values first and then transform them</div><div><br></div><div>> load("proj.cccm80a2a/Total_consensus_cccm80a2a")<br>> load("proj.had80a2a/Total_consensus_had80a2a")</div><br><blockquote type="cite"><div><div><br></div><div>> MyAverageA2A=apply(cbind(Total_consensus_cccm80a2a_Bin[,1,"prob.mean.weighted"], Total_consensus_had80a2a_Bin[,1,"prob.mean.weighted"]),1,mean)</div></div></blockquote><div><br></div><div>OK.</div><div><br></div><div>Alternative</div><div><br></div><div>MyAverageA2A = rowMeans(cbind(Total_consensus_cccm80a2a[,1,"prob.mean.weighted"], Total_consensus_had80a2a[,1,"prob.mean.weighted"]))</div><div><br></div><br><blockquote type="cite"><div><div>> MyThresA2A=apply(cbind(consensus_cccm80a2a_results[[1]][[3]][3,2], consensus_had80a2a_results[[1]][[3]][3,2]),1,mean)</div></div></blockquote><div><br></div><div><div>For the threshold, you need to remove the threshold for the models calibrated on 100% of the data</div><div>As I already explained, the thresholds are the same whatever the projections or GCM. You can use the consensus outputs from either cccm or had80, does not make any difference. </div><div><br></div><div>MyThresA2A = mean(consensus_cccm80a2a_results$Cflorida$thresholds["prob.mean.weighted", c(2:4, 6:8)]</div><div><br></div></div><br><blockquote type="cite"><div><div>> MyAverageBinA2A=BinaryTransformation(MyAverageA2A, MyThresA2A)</div><div><br></div></div></blockquote><div><br></div><div>That should work now. </div><div><br></div><div>level.plot(MyAverageA2A, Coor) <br>level.plot(MyAverageBinA2A, Coor) </div><div><br></div><div>Both should return a visual by now.</div><div><br></div><div><br></div><div>Cheers</div></div><div><br></div><div apple-content-edited="true">

<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; "><div>--------------------------</div><div>Dr. Wilfried Thuiller</div><div>Laboratoire d'Ecologie Alpine, UMR CNRS 5553</div><div>Université Joseph Fourier</div><div>BP53, 38041 Grenoble cedex 9, France</div><div>tel: +33 (0)4 76 51 44 97</div><div>fax: +33 (0)4 76 51 42 79</div><div><br></div><div>Email: <a href="mailto:wilfried.thuiller@ujf-grenoble.fr">wilfried.thuiller@ujf-grenoble.fr</a><br>Personal website: <a href="http://www.will.chez-alice.fr/">http://www.will.chez-alice.fr</a><br>Team website: <a href="http://www-leca.ujf-grenoble.fr/equipes/emabio.htm">http://www-leca.ujf-grenoble.fr/equipes/emabio.htm</a><br><br>ERC Starting Grant TEEMBIO project: <a href="http://www.will.chez-alice.fr/Research.html">http://www.will.chez-alice.fr/Research.html</a><br>FP6 European EcoChange project: <a href="http://www.ecochange-project.eu/">http://www.ecochange-project.eu</a></div><div><br></div></span></div></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></div></span><br class="Apple-interchange-newline"></span><br class="Apple-interchange-newline">

</div>

<br></body></html>