<span class="gI"></span>Dear Wilfried,<br>I updated the package and everything works perfectly now. Thank you for your prompt response..<br>Nagore<br><br><div class="gmail_quote">2010/12/7 Wilfried Thuiller <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:wilfried.thuiller@ujf-grenoble.fr">wilfried.thuiller@ujf-grenoble.fr</a>&gt;</span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><div style="word-wrap: break-word;"><div>Dear Nagore,</div><div>Rob Hijmans recently updated the raster package in a way that several functions (Projections.raster, EnsembleForecasting.raster) in BIOMOD did not work anymore.</div>
<div>I have fixed everything during the weekend and it should work now.</div><div><br></div><div>I think the package has been compiled on R-Forge so make sure you update the package and get version 1.1-6.1.</div><div><br>
</div><div>Wilfried</div><div><br></div><div><br></div><br><div><div>Le 7 déc. 2010 à 12:39, Nagore García a écrit :</div><br><blockquote type="cite"><div><div></div><div class="h5">Hi all,<br>This is my first run in BIOMOD, and I&#39;m afraid I&#39;m having troubles with Projection.raster. Here I attach de script I used, function Models() runs nicely, but then I have an error message when trying to run Projection.raster. Anybody has an idea why I get this error message?<br>

<br>ovit  <br>Error en as.numeric(g) : <br>  cannot coerce type &#39;S4&#39; to vector of type &#39;double&#39;<br><br><br>sdmdata&lt;-read.csv(&quot;sdmdata.csv&quot;)<br>head(sdmdata)<br>  idw         x        y ibe_biof1 ibe_biof10 ibe_biof11 ibe_biof12 ibe_biof13<br>

1   1 -2.238898 37.92525       114        203         39        561         72<br>2   2 -1.704232 37.92057       113        199         40        568         73<br>3   3 -2.064232 38.23942       114        201         39        551         71<br>

4   4 -3.764231 40.95501       100        185         26        532         62<br>5   5 -2.638544 42.54070       123        195         55        611         64<br>6   6 -3.764483 40.95520       100        185         26        532         62<br>

  ibe_biof14 ibe_biof15 ibe_biof16 ibe_biof17 ibe_biof18 ibe_biof19 ibe_biof2<br>1         16         34        190         71         72        152       118<br>2         19         31        188         80         81        143       116<br>

3         17         33        186         75         75        140       119<br>4         18         28        162         78         86        138       104<br>5         32         19        178        122        122        160        97<br>

6         18         28        162         78         86        138       104<br>  ibe_biof3 ibe_biof4 ibe_biof5 ibe_biof6 ibe_biof7 ibe_biof8 ibe_biof9<br>1        38      6472       296       -13       309        91       202<br>

2        38      6255       286       -13       299        89       197<br>3        38      6425       294       -15       309        92       201<br>4        36      6286       266       -17       283        60       184<br>

5        38      5484       265        15       250        90       195<br>6        36      6286       266       -17       283        60       184<br>  ibe_elevf pv<br>1      1317  1<br>2      1408  1<br>3      1370  1<br>

4      1244  1<br>5       503  1<br>6      1244  1<br><br>Initial.State(Response = sdmdata[,24], Explanatory = sdmdata[,c(23,4,14,17)],IndependentResponse = NULL,<a href="http://sp.name/" target="_blank">sp.name</a>=&quot;ovit&quot;)<br>
<br>
Models(GLM = F, TypeGLM = &quot;poly&quot;, Test = &quot;AIC&quot;, GBM = F, No.trees = 2000, GAM = T, Spline = 3, CTA = F, CV.tree = 50, ANN = F, CV.ann = 2, SRE = F, quant=0.025, FDA = F,MARS = F, RF = F, NbRunEval = 4, DataSplit = 80, Yweights=NULL, Roc = T, Optimized.Threshold.Roc = T, Kappa = T, TSS=T, KeepPredIndependent = F, VarImport=F, NbRepPA=0)<br>

Biomod.Manual()<br><br>CurrentPred(GLM=T, GBM=T, GAM=T, CTA=T, ANN=T, SRE=T, MARS=F, RF=T,BinRoc=T, BinKappa=T, BinTSS=T, FiltKappa=T)<br><br>files &lt;- list.files(&quot;<a>\\encuadre</a> iberico&quot;,pattern=&#39;asc&#39;, full.names=TRUE )<br>

pred.1 &lt;- stack(files[c(1,14,11,20)])<br><br>Projection.raster(RasterProj = pred.1, Proj.name=&#39;Pred.ovit1&#39;, GLM = T, GBM = T, GAM = T,CTA = T, ANN = T, SRE = T, MARS = T, RF = T,BinRoc = T, BinKappa = T, BinTSS = T, FiltRoc = T, FiltKappa = T, FiltTSS = T,repetition.model=T)<br clear="all">

<br>-- <br>Nagore García Medina. <a href="mailto:ngmedina@gmail.com" target="_blank">ngmedina@gmail.com</a><br></div></div>
_______________________________________________<br>Biomod-commits mailing list<br><a href="mailto:Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org" target="_blank">Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org</a><br><a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits" target="_blank">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits</a><br>
</blockquote></div><br><div>
<span style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px;"><span style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px;"><div style="word-wrap: break-word;">
<span style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px;"><div style="word-wrap: break-word;">
<div><span style="font-size: 12px;"><div>--------------------------</div><div>Dr. Wilfried Thuiller</div><div>Laboratoire d&#39;Ecologie Alpine, UMR CNRS 5553</div><div>Université Joseph Fourier</div><div>BP53, 38041 Grenoble cedex 9, France</div>
<div>tel: +33 (0)4 76 51 44 97</div><div>fax: +33 (0)4 76 51 42 79</div><div><br></div><div>Email: <a href="mailto:wilfried.thuiller@ujf-grenoble.fr" target="_blank">wilfried.thuiller@ujf-grenoble.fr</a><br>Home page: <a href="http://www.will.chez-alice.fr/" target="_blank">http://www.will.chez-alice.fr</a><br>
Website: <a href="http://www-leca.ujf-grenoble.fr/equipes/tde.htm" target="_blank">http://www-leca.ujf-grenoble.fr/equipes/tde.htm</a><br><br>FP6 European MACIS project: <a href="http://www.macis-project.net/" target="_blank">http://www.macis-project.net</a><br>
FP6 European EcoChange project: <a href="http://www.ecochange-project.eu/" target="_blank">http://www.ecochange-project.eu</a></div><div><br></div></span></div></div></span><br></div></span><br></span><br>
</div>
<br></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Nagore García Medina. <a href="mailto:ngmedina@gmail.com">ngmedina@gmail.com</a><br>