<div>Hi All.</div><div><br></div><div>I&#39;m trying to project models built with BIOMOD but I&#39;m getting the following error:</div><div><br></div><div>Error in predict.nnet(object, Proj, type = &quot;raw&quot;) : missing values in &#39;x&#39;</div>
<div><br></div><div>If I set ANN=F in the Projection call, then the error changes to:</div><div>Error in if (sum(ProbData) != 0) { : </div><div>  missing value where TRUE/FALSE needed</div><div><br></div><div>Does anyone know why this is happening and how to fix it? I suspect it could have something to do with my dataset containing NA values... is there some way to set na.action?</div>
<div><br></div><div>Here&#39;s info on my environment and data:</div><div><br></div><div>R version 2.11.1 (2010-05-31) running on Win XP SP3 (32-bit)</div><div>BIOMOD 1.1-5 2010-05-04</div><div><br></div><div>Command being used for projection:</div>
<div>&gt; Projection(Proj = other.area[,3:11], Proj.name=&quot;test&quot;, GLM = T, GBM = T, GAM = T, CTA = T, ANN = T, SRE = T, FDA =T, MARS = T, RF = T, BinRoc=T, BinKappa=T, BinTSS=T, FiltRoc=F, FiltKappa=F, FiltTSS=F, repetition.models=F)</div>
<div><br></div><div>&gt; summary(other.area)</div><div>       x                y                alt                bio1              bio10              bio11              bio12            bio15               bio16         </div>
<div> Min.   :-73.79   Min.   :-33.625   Min.   :     0.0   Min.   :     0.0   Min.   :     0.0   Min.   :     0.0   Min.   :     0   Min.   :     0.00   Min.   :     0.0  </div><div> 1st Qu.:-64.12   1st Qu.:-23.875   1st Qu.:   121.0   1st Qu.:   234.0   1st Qu.:   248.0   1st Qu.:   212.0   1st Qu.:  1342   1st Qu.:    47.00   1st Qu.:   585.0  </div>
<div> Median :-54.37   Median :-14.125   Median :   259.0   Median :   253.0   Median :   260.0   Median :   244.0   Median :  1721   Median :    65.00   Median :   797.0  </div><div> Mean   :-54.37   Mean   :-14.125   Mean   :   326.8   Mean   :   244.4   Mean   :   256.2   Mean   :   229.5   Mean   :  1754   Mean   :    60.87   Mean   :   762.3  </div>
<div> 3rd Qu.:-44.62   3rd Qu.: -4.375   3rd Qu.:   464.0   3rd Qu.:   262.0   3rd Qu.:   269.0   3rd Qu.:   256.0   3rd Qu.:  2207   3rd Qu.:    78.00   3rd Qu.:   933.0  </div><div> Max.   :-34.96   Max.   :  5.375   Max.   :  2054.0   Max.   :   280.0   Max.   :   292.0   Max.   :   272.0   Max.   :  3883   Max.   :   128.00   Max.   :  1628.0  </div>
<div>                                    NA&#39;s   :117187.0   NA&#39;s   :117187.0   NA&#39;s   :117187.0   NA&#39;s   :117187.0   NA&#39;s   :117187   NA&#39;s   :117187.00   NA&#39;s   :117187.0  </div><div>     bio17               bio4       </div>
<div> Min.   :     0.0   Min.   :     0  </div><div> 1st Qu.:    33.0   1st Qu.:   450  </div><div> Median :    87.0   Median :   718  </div><div> Mean   :   141.7   Mean   :  1075  </div><div> 3rd Qu.:   215.0   3rd Qu.:  1517  </div>
<div> Max.   :   771.0   Max.   :  4480  </div><div> NA&#39;s   :117187.0   NA&#39;s   :117187 </div><div><br></div><div><div><br></div><div>Model training seems to have completed successfully, the only warnings that appeared were:</div>
<div>glm.fit: fitted probabilities numerically 0 or 1 occurred</div><div><br></div><div>Let me know if you need more details about these issues.</div><div><br></div><div>Thanks.</div><br>-- <br>Bruno Arantes de Andrade Bueno<br>
<a href="http://twitter.com/barantes">http://twitter.com/barantes</a><br><a href="http://barantesbirdwatching.blogspot.com">http://barantesbirdwatching.blogspot.com</a><br><br>
</div>