<font color='black' size='2' face='arial'>
<div> <font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif"><br>
Hi again,<br>
<br>
You have a point on the bottom right corner which totally stands out of the rest (or maybe several points)<br>
Try to find it in your data, take it off and plot again to see what you get. You can take the line out by doing this :<br>
<br>
<br>
</font></font>level.plot(My.Data[<font color="blue"><font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif">-156</font></font></font>,5], Coors, title='var 3')<font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif">&nbsp; <font color="blue">that would be if the line you wish to take off is line 156</font></font></font><br>
</div>

<div> <font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif"><font color="blue">or create a new object</font><br>
My.Data.NEW &lt;- </font></font>My.Data[<font color="blue"><font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif">-156</font></font></font>,<font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif"> </font></font>]<br>
<font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif"><br>
<br>
Also, do consider that Arcgis has a way to represent the roundness of the world, especially true for a large<br>
scale like yours. R doesn't do this and flattens the whole area which produces a differences.<br>
<br>
But it is true that the bottom part of your data is missing from the plot. Maybe it is due to the number of points<br>
you are trying to visualise which possibly leads to a saturation for R's plotting device. How many points do you have ?<br>
<br>
Bruno<br>
<br>
<br>
<br>
</font></font></div>

<div style="clear: both;">-------<br>
Bruno Lafourcade<br>
Statistical tools engineer<br>
<br>
Laboratoire d'Ecologie Alpine, bureau 308<br>
CNRS - UMR 5553, 2233 rue de la piscine<br>
38400 Saint Martin d'Hères<br>
-------</div>

<div> <br>
</div>

<div> <br>
</div>

<div style="font-family: arial,helvetica; font-size: 10pt; color: black;">-----E-mail d'origine-----<br>
De : Ashley Brooks &lt;ashleycbrooks84@gmail.com&gt;<br>
A : biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org<br>
Envoyé le : Jeudi, 16 Septembre 2010 15:31<br>
Sujet : [Biomod-commits] discrepancies<br>
<br>






<div id="AOLMsgPart_3_de638867-6e6f-4d69-bae1-18a7b2c54de4">

Hello,<br>
<br>
Please forgive me for being slow at this and for having so many questions.&nbsp; I sampled my climate data in arcgis and then imported the .dbf file into R/Biomod to run.&nbsp; Shown below are the commands I used to retrieve this data.&nbsp; Then I did a level.plot to see my data in R.&nbsp; Attached are the images of what I got from R and what I see in arcgis.&nbsp; From what I can tell everything is the same (the number of coulmns and rows in my dbf are the same when viewed in R and in arcgis).&nbsp; I guess I don't understand why they look so different.&nbsp; Again, sorry for all the questions, but any help or advice or ideas would be most appreciated!<br>

<br>
Thank you so much,<br>
Ashley<br>
<br>
<br>
&nbsp;My.Data &lt;- read.dbf("C:/Documents and Settings/New User/My Documents/curoccdata.dbf")<br>
&gt; Coors &lt;- read.dbf("C:/Documents and Settings/New User/My Documents/Coors.dbf")<br>

&gt; head(My.Data)<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; X&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Y curbio1cli curbio2cli curbio7cli curbio12cl curbio15cl<br>
1 -95.14583 49.35417&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 22&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 112&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 491&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 568&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 54<br>
2 -95.10416 49.35417&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 22&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 112&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 491&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 570&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 54<br>

3 -95.06250 49.35417&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 22&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 112&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 490&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 572&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 54<br>
4 -95.02083 49.35417&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 22&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 111&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 491&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 573&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 54<br>
5 -95.14583 49.31251&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 21&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 113&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 492&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 567&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 55<br>

6 -95.10416 49.31251&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 22&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 113&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 492&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 567&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 55<br>
&nbsp; curbio17cl Occurance<br>
1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 60&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>
2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 60&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>
3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 60&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>
4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 60&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>
5&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 57&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>

6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 57&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>
&gt; head(Coors)<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; X&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Y<br>
1 -95.14583 49.35417<br>
2 -95.10416 49.35417<br>
3 -95.06250 49.35417<br>
4 -95.02083 49.35417<br>
5 -95.14583 49.31251<br>
6 -95.10416 49.31251<br>
&gt; level.plot(My.Data[,5], Coors, title='var 3')<br>


</div>
 <!-- end of AOLMsgPart_3_de638867-6e6f-4d69-bae1-18a7b2c54de4 -->


<div id="AOLMsgPart_6_de638867-6e6f-4d69-bae1-18a7b2c54de4" style="margin: 0px; font-family: Tahoma,Verdana,Arial,Sans-Serif; font-size: 12px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

<pre style="font-size: 9pt;"><tt>_______________________________________________<br>
Biomod-commits mailing list<br>
<a href="mailto:Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org">Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits" target="_blank">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits</a><br>
</tt></pre>
</div>
 <!-- end of AOLMsgPart_6_de638867-6e6f-4d69-bae1-18a7b2c54de4 -->

<br>





</div>
</font>