<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Thank you very much Wilfried.<br>
    Best,<br>
    <br>
    Manuel<br>
    <br>
    On 11/09/2010 06:59 a.m., Wilfried Thuiller wrote:
    <blockquote
      cite="mid:7F5D84CB-D74A-4CCF-AB96-D2AD07D87006@ujf-grenoble.fr"
      type="cite">
      <div>You have different way.</div>
      <div>Either your data are already in a shapefile with associated
        coordinate files, or they are simply a txt files with
        coordinates and you know the projection system</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>1- Use the rgdal package.</div>
      <div>
        <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
          rgb(176, 20, 12);"><span style="color: rgb(0, 113, 40);">library</span><span
            style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span><span style="color:
            rgb(0, 113, 40);">rgdal</span><span style="color: rgb(4, 34,
            153);">)</span><span style="font: 13px 'Lucida Grande';
            color: rgb(4, 34, 153);"><br>
          </span><span style="color: rgb(0, 113, 40);">poly</span><span
            style="color: rgb(4, 34, 153);"> &lt;- </span><span
            style="color: rgb(0, 113, 40);">readOGR</span><span
            style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span>"path_to_the_right_folder"<span
            style="color: rgb(4, 34, 153);">, </span><span
            style="color: rgb(0, 113, 40);">layer</span><span
            style="color: rgb(4, 34, 153);">=</span>"name_of_the_files_without_extension"<span
            style="color: rgb(4, 34, 153);">)</span><span style="font:
            13px 'Lucida Grande'; color: rgb(4, 34, 153);"><br>
          </span><span style="color: rgb(0, 113, 40);">summary</span><span
            style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span><span style="color:
            rgb(0, 113, 40);">poly</span><span style="font: 13px 'Lucida
            Grande'; color: rgb(4, 34, 153);">)</span></div>
      </div>
      <div><span style="font: 13px 'Lucida Grande'; color: rgb(4, 34,
          153);"><br>
        </span></div>
      <div><font class="Apple-style-span" size="3" color="#042299"
          face="'Lucida Grande'"><span class="Apple-style-span"
            style="font-size: 13px;"><br>
          </span></font></div>
      <div><font class="Apple-style-span" size="3" color="#042299"
          face="'Lucida Grande'"><span class="Apple-style-span"
            style="font-size: 13px;">2- In a text file you import in R
            with the name 'plots'</span></font></div>
      <div><font class="Apple-style-span" size="3" color="#042299"
          face="'Lucida Grande'"><span class="Apple-style-span"
            style="font-size: 13px;">Let's say you use the WGS84
            projections and the coordinates are in columns X_WGS84 and
            Y_WGS84</span></font></div>
      <div><font class="Apple-style-span" size="3" color="#042299"
          face="'Lucida Grande'"><span class="Apple-style-span"
            style="font-size: 13px;">
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(176, 20, 12);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);">&nbsp;</span><span
                style="color: rgb(0, 113, 40);">pointsWGS84</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);"> &lt;- </span><span
                style="color: rgb(0, 113, 40);">plots</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">[,</span><span
                style="color: rgb(0, 113, 40);">c</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span>"X_WGS84"<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">, </span>"Y_WGS84"<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">)]</span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);">&nbsp;</span>colnames<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span>pointsWGS84<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">) &lt;- </span>c<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span><span
                style="color: rgb(176, 20, 12);">"x"</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">,</span><span
                style="color: rgb(176, 20, 12);">"y"</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">)</span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);">&nbsp;</span>coordinates<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span>pointsWGS84<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">) &lt;- </span>c<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span><span
                style="color: rgb(176, 20, 12);">"x"</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">, </span><span
                style="color: rgb(176, 20, 12);">"y"</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">)</span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);">###
                stipulate to R what is the projection. Look at the help
                file for proj4string</span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(176, 20, 12);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);">&nbsp;</span><span
                style="color: rgb(0, 113, 40);">proj4string</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span><span
                style="color: rgb(0, 113, 40);">pointsWGS84</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">) &lt;- </span><span
                style="color: rgb(0, 113, 40);">CRS</span><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span>"+proj=latlong
              +datum=WGS84"<span style="color: rgb(4, 34, 153);">) </span><span
                style="color: rgb(169, 65, 203);"># WGS84 projection
                string</span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);">&nbsp;</span>head<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span>pointsWGS84<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">@</span>coords<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">)</span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);"><br>
              </span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);">#if
                you want to transform the coordinates in another
                projection system. For instance here in Lambert for
                France II &eacute;tendu.</span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);">#
                first create the projection file:&nbsp;</span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);"><br>
            </div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);">
              <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
                rgb(176, 20, 12);"><span style="color: rgb(0, 113, 40);">proj4NTFII</span><span
                  style="color: rgb(4, 34, 153);"> &lt;- </span>"+proj=lcc
                +lat_1=46.8 +lat_0=46.8 +lon_0=0 +k_0=0.99987742
                +x_0=600000 +y_0=2200000 +a=6378249.2 +b=6356515
                +towgs84=-168,-60,320,0,0,0,0 +pm=paris +units=m
                +no_defs"</div>
              <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
                rgb(169, 65, 203);"><span style="color: rgb(4, 34,
                  153);">&nbsp; </span>#EPSG Projection 27582 - NTF (Paris)
                / France II</div>
              <div><br>
              </div>
              <div><br>
              </div>
            </div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);"><span style="color: rgb(4, 34, 153);"></span>pointsNTFII<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);"> &lt;- </span><b>spTransform</b><span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span>pointsWGS84<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">, </span>CRS<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">(</span>proj4NTFII<span
                style="color: rgb(4, 34, 153);">))</span></div>
            <div style="margin: 0px; font: 13px 'Courier New'; color:
              rgb(0, 113, 40);">head<span style="color: rgb(4, 34,
                153);">(</span>pointsNTFII<span style="color: rgb(4, 34,
                153);">@</span>coords<span style="color: rgb(4, 34,
                153);">)&nbsp;</span></div>
          </span></font></div>
      <div><font class="Apple-style-span" size="3" color="#042299"
          face="'Lucida Grande'"><span class="Apple-style-span"
            style="font-size: 13px;"><br>
          </span></font></div>
      <div>You have most of the projection system here:</div>
      <div><br>
      </div>
      <div><a moz-do-not-send="true"
          href="http://www.remotesensing.org/geotiff/proj_list/">http://www.remotesensing.org/geotiff/proj_list/</a></div>
      <div><br>
      </div>
      <div><br>
      </div>
      <div><br>
      </div>
      <br>
      <div>
        <div>Le 10 sept. 2010 &agrave; 22:36, Manuel Sp&iacute;nola a &eacute;crit :</div>
        <br class="Apple-interchange-newline">
        <blockquote type="cite">
          <div> Dear list members,<br>
            <br>
            How do I import data in geographical coordinates to R?<br>
            <br>
            ref1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;ref2<br>
            N10 41 08.7 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;W84 10 46.3<br>
            N10 41 06.8 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;W84 10 46.4<br>
            N10 41 06.4 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;W84 10 44.6<br>
            N10 41 05.6 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;W84 10 46.0<br>
            <br>
            Best,<br>
            <br>
            Manuel<br>
            <br>
            -- <br>
            Manuel Sp&iacute;nola, Ph.D.<br>
            Instituto Internacional en Conservaci&oacute;n y Manejo de Vida
            Silvestre<br>
            Universidad Nacional<br>
            Apartado 1350-3000<br>
            Heredia<br>
            COSTA RICA<br>
            <a moz-do-not-send="true" href="mailto:mspinola@una.ac.cr">mspinola@una.ac.cr</a><br>
            <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:mspinola10@gmail.com">mspinola10@gmail.com</a><br>
            Tel&eacute;fono: (506) 2277-3598<br>
            Fax: (506) 2237-7036<br>
            <br>
            _______________________________________________<br>
            Biomod-commits mailing list<br>
            <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org">Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org</a><br>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits</a><br>
          </div>
        </blockquote>
      </div>
      <br>
      <div>
        <div style="word-wrap: break-word;">
          <div style="word-wrap: break-word;">
            <div><span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px;">
                <div>--------------------------</div>
                <div>Dr. Wilfried Thuiller</div>
                <div>Laboratoire d'Ecologie Alpine, UMR CNRS 5553</div>
                <div>Universit&eacute; Joseph Fourier</div>
                <div>BP53, 38041 Grenoble cedex 9, France</div>
                <div>tel: +33 (0)4 76 51 44 97</div>
                <div>fax: +33 (0)4 76 51 42 79</div>
                <div><br>
                </div>
                <div>Email:&nbsp;<a moz-do-not-send="true"
                    href="mailto:wilfried.thuiller@ujf-grenoble.fr">wilfried.thuiller@ujf-grenoble.fr</a><br>
                  Home page:&nbsp;<a moz-do-not-send="true"
                    href="http://www.will.chez-alice.fr/">http://www.will.chez-alice.fr</a><br>
                  Website:&nbsp;<a moz-do-not-send="true"
                    href="http://www-leca.ujf-grenoble.fr/equipes/tde.htm">http://www-leca.ujf-grenoble.fr/equipes/tde.htm</a><br>
                  <br>
                  FP6 European MACIS project:&nbsp;<a moz-do-not-send="true"
                    href="http://www.macis-project.net/">http://www.macis-project.net</a><br>
                  FP6 European EcoChange project:&nbsp;<a
                    moz-do-not-send="true"
                    href="http://www.ecochange-project.eu/">http://www.ecochange-project.eu</a></div>
                <div><br>
                </div>
              </span></div>
          </div>
          <br class="Apple-interchange-newline">
        </div>
        <br class="Apple-interchange-newline">
        <br class="Apple-interchange-newline">
      </div>
      <br>
    </blockquote>
    <br>
    <br>
    <pre class="moz-signature" cols="72">-- 
Manuel Sp&iacute;nola, Ph.D.
Instituto Internacional en Conservaci&oacute;n y Manejo de Vida Silvestre
Universidad Nacional
Apartado 1350-3000
Heredia
COSTA RICA
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:mspinola@una.ac.cr">mspinola@una.ac.cr</a>
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:mspinola10@gmail.com">mspinola10@gmail.com</a>
Tel&eacute;fono: (506) 2277-3598
Fax: (506) 2237-7036</pre>
  </body>
</html>