<font color='black' size='2' face='arial'>
<div> <font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif"><br>
</font></font><br>

<font size="2"><font face="Arial, Helvetica, sans-serif">Hi Manuela and other BIOMODers,<br>

<br>

<br>

I am very puzzled with this one. I have encounetered it several times before and it seems to come from<br>

various possibilities and I haven't yet figured out how to solve it completely. <br>

<br>

I believe some of the operations that the function is to be doing are
encountering absent data, at least that's what I came up with.<br>

I would advise you to try and switch on/off some of the arguments. I
believe "binary" and "Test" would surely make a difference if<br>

switched off.<br>

<br>

Also, maybe just setting "repetition.models" to TRUE might skip the problem even if the others are kept as FALSE. It is a late <br>

improvement and might not totally be bug free on the overall of the function.<br>

<br>

Thanks for reporting any advances.<br>

Bruno<br>

<br>

</font></font> <br>
</div>

<div> <br>
</div>

<div id="sig7026" style="clear: both;"><font>-------<br>
Bruno Lafourcade<br>
Statistical tools engineer<br>
<br>
Laboratoire d'Ecologie Alpine, bureau 308<br>
CNRS - UMR 5553, 2233 rue de la piscine<br>
38400 Saint Martin d'Hères<br>
-------</font></div>

<div> <br>
</div>

<div> <br>
</div>

<div style="font-family: arial; font-size: 10pt; color: black;">-----E-mail d'origine-----<br>
De : mdamen@uniroma3.it<br>
A : biomod-commits@r-forge.wu-wien.ac.at<br>
Envoyé le : Jeudi, 3 Décembre 2009 15:24<br>
Sujet : [Biomod-commits] error message Ensemble.Forecasting function<br>
<br>






<div id="AOLMsgPart_0_2a51a771-3109-49cf-a7bd-e412d0d3616b" style="margin: 0px; font-family: Tahoma,Verdana,Arial,Sans-Serif; font-size: 12px; color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255);">

<pre style="font-size: 9pt;"><tt>Dear all,<br>
<br>
I encountered a problem with the Ensemble.Forecasting() function.<br>
<br>
I am working on 1 species (678 obs. - 10 variables).<br>
<br>
I get models with the function:<br>
Models(GLM=T, TypeGLM="poly", Test="AIC", GBM=T, No.trees = 5000, GAM= T,<br>
CTA=T, CV.tree =50, ANN=T, CV.ann=3, SRE=F, Perc025=TRUE, Perc05=FALSE,<br>
MDA=T, MARS=T, RF=T, NbRunEval = 3, DataSplit = 80, VarImport=5, Roc = T, <br>
      Optimized.Threshold.Roc = T, Kappa = F, TSS = F)<br>
<br>
... then I projected the models:<br>
Projection (Proj = pres[,4:13], Proj.name="pres", GLM = T, GBM = T, GAM = T,<br>
CTA = T, ANN = T, SRE = F, Perc025 = T, Perc05 = F, MDA =T, MARS = T, RF =<br>
T, BinRoc = T, BinKappa = F, BinTSS = F, FiltRoc = F, FiltKappa = F,<br>
FiltTSS = F, repetition.models = F)<br>
<br>
finally the Ensemble.Forecasting function -<br>
<br>
Ensemble.Forecasting(Proj.name= "pres", weight.method = "Roc", decay = 1.6,<br>
                    PCA.median = F, binary = T, bin.method = "Roc",<br>
                    Test = T, repetition.models = F)<br>
<br>
gave me this error:<br>
<br>
Errore in if (sum(ProbData) != 0) { :<br>
  valore mancante dove è richiesto TRUE/FALSE<br>
<br>
(The english translation of the second line is: "missig value where<br>
TRUE/FALSE is required")<br>
<br>
What is wrong?<br>
I would be very grateful for any help<br>
<br>
Manuela<br>
<br>
-- <br>
Manuela D'Amen<br>
PhD student<br>
Lab Zoology and Animal Biology<br>
Department of Environmental Biology<br>
University of Roma Tre, Rome, Italy<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Biomod-commits mailing list<br>
<a href="mailto:Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org">Biomod-commits@lists.r-forge.r-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits" target="_blank">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/biomod-commits</a><br>
</tt></pre>
</div>
 <!-- end of AOLMsgPart_0_2a51a771-3109-49cf-a7bd-e412d0d3616b -->

</div>
</font>