<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Dear Janice</div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><br></div><div><div class="gmail_default" style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif">this was entirely my fault. After spending time developing the method, getting it published, documenting it in a separate vignette, I managed to miss that warning in the manpage of the method. I have sent a PR to fix this in the devel version of adegenet back in June:</div><div class="gmail_default" style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif"><a href="https://github.com/thibautjombart/adegenet/pull/287">https://github.com/thibautjombart/adegenet/pull/287</a></div><div class="gmail_default" style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif">It has not gone through (some automated tests errored), will check why.</div><div class="gmail_default" style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif">Best</div><div class="gmail_default" style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif">Thibaut</div><div class="gmail_default" style="font-family:"trebuchet ms",sans-serif"></div><br></div><div><br></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">--<br>Dr Thibaut Jombart<br>Associate Professor in Outbreak Analytics, London School of Hygiene and Tropical Medicine<br>Senior Lecturer in Genetic Analysis, Imperial College London</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">UK Public Health Rapid Support Team</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">President of RECON: <a href="http://repidemicsconsortium.org" target="_blank">repidemicsconsortium.org</a></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><a href="https://thibautjombart.netlify.com" style="letter-spacing:0.2px" target="_blank">https://thibautjombart.netlify.com</a><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Twitter: @TeebzR</font><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, 30 Sep 2020 at 10:14, Janice Boyd <<a href="mailto:jboyd46@gmail.com">jboyd46@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Hi: When I went looking for information on snapclust, I found this warning:  (<a href="https://rdrr.io/cran/adegenet/man/snapclust.html" target="_blank">https://rdrr.io/cran/adegenet/man/snapclust.html</a>)</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">DESCRIPTION<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">
Do not use. We work on that stuff. Contact us if interested. <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">How should I interpret this?  Does it mean don't use snapclust?</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Janice Boyd</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Texas A&M<br></div></div>
_______________________________________________<br>
adegenet-forum mailing list<br>
<a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org" target="_blank">adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum</a></blockquote></div>