<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Hi there</div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">the squared loadings sum to 1, which should give you a scale for the contributions of individual loadings. From what you describe, it seems that indeed no specific allele has a strong contribution to the diversity highlighted by DAPC.</div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Best</div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Thibaut</div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><br></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">--<br>Dr Thibaut Jombart<br>Associate Professor in Outbreak Analytics, London School of Hygiene and Tropical Medicine<br>Senior Lecturer in Genetic Analysis, Imperial College London</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">UK Public Health Rapid Support Team</font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">President of RECON: <a href="http://repidemicsconsortium.org" target="_blank">repidemicsconsortium.org</a></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif"><a href="https://thibautjombart.netlify.com" style="letter-spacing:0.2px" target="_blank">https://thibautjombart.netlify.com</a><br></font></div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Twitter: @TeebzR</font><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, 30 Sep 2020 at 10:14, Burton, Andrea Rae <<a href="mailto:burtoand@oregonstate.edu">burtoand@oregonstate.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>I was wondering how important the absolute value of loading is. Compared to other papers and the tutorial, the loading values I get are very low (~0.00015). Does this indicate that there isn't much variation between loads for my data set, or do things like large sample size attribute?</div><div><br></div><div>Thank you,</div><div><br></div><div>Andrea<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr">PhD Candidate<div>Integrative Biology Department</div><div>Oregon State University</div><div>Pronouns: she/her/hers</div><div>_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_,~"(_</div><div><span style="color:rgb(34,34,34)">Oregon State University in Corvallis, OR, is located within the traditional homelands of the Mary's River or Ampinefu Band of the Kalapuya. Following the Willamette Valley Treaty of 1855 (Kalapuya etc. Treaty), Kalapuya people were forcibly removed to reservations in Western Oregon. Today, living descendants of </span><span style="color:rgb(34,34,34)">the Kalapuya</span><span style="color:rgb(34,34,34)"> are a part of the </span><a href="https://www.grandronde.org/" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank"><font color="#0000ff">Confederated Tribes of Grand Ronde Community of Oregon </font></a><span style="color:rgb(34,34,34)">and the</span><font color="#0000ff"> <a href="http://www.ctsi.nsn.us/" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank"><font color="#0000ff">Confederated Tribes of the Siletz Indians.</font></a></font><br></div></div></div></div></div>
_______________________________________________<br>
adegenet-forum mailing list<br>
<a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org" target="_blank">adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum</a></blockquote></div>