<div dir="ltr">Hi there<div><br></div><div>this is not exactly recommended practice, as the color is supposed to reflect the clustering. If you want to do this, the best way is to make the plot from scratch using adegraphics:</div><div><a href="https://cran.r-project.org/web/packages/adegraphics/vignettes/adegraphics.html">https://cran.r-project.org/web/packages/adegraphics/vignettes/adegraphics.html</a><br></div><div><br></div><div>Best</div><div>Thibaut</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><br>--<br>Dr Thibaut Jombart<br>Lecturer, Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London<br>Head of RECON: <a href="http://repidemicsconsortium.org" target="_blank">repidemicsconsortium.org</a><br>WHO Consultant - outbreak analysis</div><div><a href="https://thibautjombart.netlify.com" target="_blank">https://thibautjombart.netlify.com</a><br>Twitter: @TeebzR<br>+44(0)20 7594 3658</div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On 13 April 2018 at 16:10, Alicia Reigel <span dir="ltr"><<a href="mailto:reige012@gmail.com" target="_blank">reige012@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>I'm having some trouble working through an issue in DAPC. I've been using scatter and DAPC to plot my points from microsatellite data. I have definitely figured out how to cluster and color the points for the individuals by their genetic cluster and by their original populations, but what I can't determine is how to color each point by the original source population, but cluster them by their genetic cluster.  Can anyone help me with this? </div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Alicia Reigel<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br clear="all"><div><br></div>-- <br></font><div class="m_3321659199240653426gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><font color="#888888"></font><div dir="ltr"><font color="#888888"></font><div><font color="#888888"></font><div dir="ltr"><font color="#888888"></font><div dir="ltr"><font color="#888888"></font><div dir="ltr"><font color="#888888"></font><div dir="ltr"><font color="#888888"></font><div dir="ltr"><font color="#888888"><div style="font-family:arial;font-size:small">Ph.D. Candidate, Louisiana State University | Michael E.Hellberg Lab<br></div><div style="font-family:arial;font-size:small"><font><font>M.S. Biology, Georgia Southern University | Daniel F. Gleason Lab</font></font></div><div style="font-family:arial;font-size:small"><font><font><font><font>Lab Phone: (225) 578-9114</font></font></font></font></div></font><div style="font-family:arial;font-size:small"><font color="#888888"><font><font><font><font>Email: </font></font></font></font></font><font><font><a href="mailto:areige1@lsu.edu" target="_blank"><font><font>areige1@lsu.edu</font></font></a> </font></font></div><div style="font-family:arial;font-size:small">Website: <a href="http://aliciamreigel.wordpress.com" target="_blank">aliciamreigel.wordpress.com</a></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</span></div></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
adegenet-forum mailing list<br>
<a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org">adegenet-forum@lists.r-forge.<wbr>r-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.r-forge.r-<wbr>project.org/cgi-bin/mailman/<wbr>listinfo/adegenet-forum</a><br></blockquote></div><br></div>