<html xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8"><meta name=Generator content="Microsoft Word 15 (filtered medium)"><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:_PDMS_Saleem_QuranFont;
        panose-1:2 1 0 0 0 0 0 0 0 0;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style></head><body lang=EN-US link=blue vlink="#954F72"><div class=WordSection1><p class=MsoNormal><span style='font-size:12.0pt;font-family:_PDMS_Saleem_QuranFont;color:black'>Hi<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black'>I read my dart date set using dart R  package (62 genotype and 12500 snp loci).<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman",serif;color:black'>I built a DAPC scatter plot   without using a priori grouping information using this command line: dapc <- dapc(data, grp$grp).</span>grp was created by using find.clusters command. But in scatter plot (I used scatter(dapc) command) only three points representing each group were seen and individuals were not shown in scatter plot.  <span style='font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman",serif'>I couldn’t find the reason and I hope to got help on that.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman",serif'>Thanks for your help<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman",serif'>Amir<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Times New Roman",serif'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Times New Roman",serif'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>Sent from <a href="https://go.microsoft.com/fwlink/?LinkId=550986">Mail</a> for Windows 10</p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p></div></body></html>