<div dir="ltr">Can you post an issue on github, copy-paste the results of the install, and add your session info?<div><br></div><div>Best</div><div><br></div><div>Thibaut</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div><div><br>--<br>Dr Thibaut Jombart</div><div style="font-size:small">Lecturer, Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London</div></div><div><span style="font-size:12.8px">Head of RECON: </span><span style="font-size:12.8px"><a href="http://repidemicsconsortium.org" target="_blank">repidemicsconsortium.org</a></span><br></div></div><div><a href="http://sites.google.com/site/thibautjombart/" style="font-size:12.8px" target="_blank">sites.google.com/site/thibautjombart/</a><br></div><div><a href="http://github.com/thibautjombart" target="_blank">github.com/thibautjombart</a></div>Twitter: <a href="http://twitter.com/TeebzR" target="_blank">@TeebzR</a><br></div><div dir="ltr">+44(0)20 7594 3658</div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On 24 April 2017 at 15:58, Andres, Jose <span dir="ltr"><<a href="mailto:jose.andres@usask.ca" target="_blank">jose.andres@usask.ca</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#ffffff;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>Hi Thibaut,<br>
</p>
<p>I Just tried to install devtools from my Xquartz (i.e. X11) using a vanilla R (3.4.0) session. Unfortunately, I still get the same error. Any thoughts? </p>
<p><br>
</p>
<p>Thanks a lot!<br>
</p>
<p>/Jose</p>
<p> <br>
</p>
<div style="color:rgb(33,33,33)">
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div id="m_7689242626973602739divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Thibaut Jombart <<a href="mailto:thibautjombart@gmail.com" target="_blank">thibautjombart@gmail.com</a>><br>
<b>Sent:</b> Monday, April 24, 2017 7:27 AM<br>
<b>To:</b> Andres, Jose<br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org" target="_blank">adegenet-forum@lists.r-forge.<wbr>r-project.org</a><br>
<b>Subject:</b> Re: [adegenet-forum] supplementary individual analyses: install devol error</font>
<div> </div>
</div><div><div class="h5">
<div>
<div dir="ltr">Hi Jose 
<div><br>
</div>
<div>this looks like a devtools issue. Can you please try with the current version of R, using a vanilla session (R --vanilla)?</div>
<div><br>
</div>
<div>Best</div>
<div>Thibaut</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br clear="all">
<div>
<div class="m_7689242626973602739gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<div>
<div>
<div><br>
--<br>
Dr Thibaut Jombart</div>
<div style="font-size:small">Lecturer, Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London</div>
</div>
<div><span style="font-size:12.8px">Head of RECON: </span><span style="font-size:12.8px"><a href="http://repidemicsconsortium.org" target="_blank">repidemicsconsortium.<wbr>org</a></span><br>
</div>
</div>
<div><a href="http://sites.google.com/site/thibautjombart/" style="font-size:12.8px" target="_blank">sites.google.com/site/<wbr>thibautjombart/</a><br>
</div>
<div><a href="http://github.com/thibautjombart" target="_blank">github.com/thibautjombart</a></div>
Twitter: <a href="http://twitter.com/TeebzR" target="_blank">@TeebzR</a><br>
</div>
<div dir="ltr"><a href="tel:+44%2020%207594%203658" value="+442075943658" target="_blank">+44(0)20 7594 3658</a></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br>
<div class="gmail_quote">On 21 April 2017 at 20:22, Andres, Jose <span dir="ltr">
<<a href="mailto:jose.andres@usask.ca" target="_blank">jose.andres@usask.ca</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#ffffff;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p></p>
<div>Hi there,</div>
<div>I am working on the assignment of supplementary individuals to one of my previous DAPC analyses. Because the know issues with the predict.dapc of the repository version (2.0.1) I'd like to use the devol version of Adegenet. Unfortunately, my compilation
 fails because of the following error: <br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>invalid active developer path (/Library/Developer/CommandLin<wbr>eTools), missing xcrun at: /Library/Developer/CommandLin site:<a href="http://lists.r-forge.r-project.org/pipermail/adegenet-forum/" target="_blank">lists.r-forge.r-project.o<wbr>rg/pipermail/adegenet-forum/</a></div>
<div><br>
</div>
<div>ERROR: compilation failed for package ‘adegenet’</div>
<div>* removing ‘/Library/Frameworks/R.framewo<wbr>rk/Versions/3.3/Resources/<wbr>library/adegenet’</div>
<div>* restoring previous ‘/Library/Frameworks/R.framewo<wbr>rk/Versions/3.3/Resources/<wbr>library/adegenet’</div>
<div><br>
</div>
<div>Any suggestions on how to fix this? I am using R 3.3.2 GUI 1.68 Mavericks build (7288) under a MacOC Sierra 10.12</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks!</div>
<span class="m_7689242626973602739HOEnZb"><font color="#888888">
<div><br>
<br>
</div>
<p>/Jose Andres<br>
</p>
</font></span></div>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
adegenet-forum mailing list<br>
<a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org" target="_blank">adegenet-forum@lists.r-forge.r<wbr>-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.r-forge.r-projec<wbr>t.org/cgi-bin/mailman/listinfo<wbr>/adegenet-forum</a><br>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div></div></div>
</div>

</blockquote></div><br></div>