<html><body><div style="font-family: trebuchet ms,sans-serif; font-size: 12pt; color: #000000"><div>Can you provide a reproducible example?</div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>FWIW, you can use accessor functions like `tab(genind_obj)` or access the other slot through `other(genind_obj)`, e.g.</div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>library(adegenet)<br><br>data(nancycats)<br><br>other(nancycats)$xy</div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>or assigning things </div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div><span style="color: #000000; font-family: 'trebuchet ms', sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: #ffffff; display: inline !important; float: none;" data-mce-style="color: #000000; font-family: 'trebuchet ms', sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; background-color: #ffffff; display: inline !important; float: none;">other(nancycats)$xy <- xy_object</span></div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>To access genotypes, you can use </div><div><br>tab(nancycats)</div><div><br></div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div>Cheers,</div><div>Roman</div><div><br data-mce-bogus="1"></div><div data-marker="__SIG_PRE__">----<br>In god we trust, all others bring data.</div><br><hr id="zwchr" data-marker="__DIVIDER__"><div data-marker="__HEADERS__"><b>From: </b>"Tagliamonte,Massimiliano S" <mstagliamonte@ufl.edu><br><b>To: </b>"adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org" <adegenet-forum@r-forge.wu-wien.ac.at><br><b>Sent: </b>Tuesday, January 3, 2017 10:36:20 PM<br><b>Subject: </b>Re: [adegenet-forum] df2genind function unexpected behavior<br></div><br><div data-marker="__QUOTED_TEXT__"><style style="display: none;" data-mce-style="display: none;"><!--P{margin-top:0;margin-bottom:0;} p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}--></style>


<p>Update:</p>
<p>OK, I have replaced the dots (".") in the names with "_", now the order of the isolates is maintained. I'll have to keep in mind this behavior. I guess it's a bad idea to introduce special characters in my data in R.</p>
<p><br>
</p>
<p>Sincerely,</p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;" data-mce-style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;">
<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;" data-mce-style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;">
<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;" data-mce-style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;">Massimiliano S. Tagliamonte</div>
<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;" data-mce-style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;">Graduate Student</div>
<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;" data-mce-style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;">University of Florida<br>
College of Veterinary Medicine</div>
<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;" data-mce-style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;">Department of Infectious Diseases and Pathology<br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div dir="ltr" style="font-size: 12pt; color: #000000; background-color: #ffffff; font-family: Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;" data-mce-style="font-size: 12pt; color: #000000; background-color: #ffffff; font-family: Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<hr style="display: inline-block; width: 98%;" data-mce-style="display: inline-block; width: 98%;">
</div>


<br>_______________________________________________<br>adegenet-forum mailing list<br>adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org<br>https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum<br></div></div></body></html>