<div dir="ltr"><div><div><div>Dear All<br><br></div>I have recently used PCoA in adegenet to produce the following graph, using the s.class function (shown in attachment). Once i defined my PCoA data as the variable "pca.kelp" i inputted this into adegenet:<br><br>s.class(pca.cows$li, fac=pop(microbov), col=funky(15))<br><br></div>s.class(pca.kelp$li, fac=pop(genind1), <br>   +col=transp(funky(15),.6),<br></div>   +axesel=FALSE, cstar=0, cpoint=3)<br><div><div><br></div><div>I am fairly new to R statistics and would appreciate your time.<br><br></div><div>Many thanks<br></div><div>Max<br></div></div></div>