<p dir="ltr">Hi Jenny</p>
<p dir="ltr">You need to read your sequence into R and then convert it to a genind. This is documented in several places but a starting point is the basics tutorial - see for instance fasta2DNAbin and DNAbin2genind.</p>
<p dir="ltr">Cheers<br>
Thibaut</p>
<div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 16 Aug 2016 06:51, "Jennifer Austin" <<a href="mailto:jenifaus@gmail.com">jenifaus@gmail.com</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello all<div><br></div><div>I have a dataset of 200 individuals and for each of them there is a 900 bp sequence of COI with 68 polymorphic sites. I want to use find.clusters function in the package adegent and I want to know how can I prepare my dataset to use them in the analysis. Is there any example file that can help me how to prepare my data?</div><div>I would appreciate any help.</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Jenny</div></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
adegenet-forum mailing list<br>
<a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org">adegenet-forum@lists.r-forge.<wbr>r-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.r-forge.r-<wbr>project.org/cgi-bin/mailman/<wbr>listinfo/adegenet-forum</a><br></blockquote></div><br></div>