<div dir="ltr"><div style="font-size:12.8px">I need to compute pairwise genetic distances for the HGDP populations. Adegenet works with genind and genpop objects.</div><div style="font-size:12.8px">I downloaded the HGDP file from: <a href="http://www.hagsc.org/hgdp/files.html">http://www.hagsc.org/hgdp/files.html</a></div><div style="font-size:12.8px">Can anyone explain to me how to convert this to work with adegenet?</div><div style="font-size:12.8px">I know that calculation of genetic distances requires conversion of genind to genpop object. However, being new to this, I do not know which format the HGDP-CEPH <strong style="color:rgb(0,0,0);font-family:Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:16px">HGDP_FinalReport_Forward.txt</strong><span style="font-size:12.8px"> file is. Is it genind ? If not, how do I convert this to genind?</span></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Many thanks in advance,</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Davide</div></div>