
<html><body><div style="font-family: trebuchet ms,sans-serif; font-size: 12pt; color: #000000"><div>Hi,</div><div><br></div><div>how much RAM does your machine have? Sometimes it's easier to just run the analysis on a more powerful machine. If you're already tipping the edge, parallelization would be a viable step.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>Roman</div><div><br></div><div><span name="x"></span>----<br>In god we trust, all others bring data.<span name="x"></span><br></div><div><br></div><hr id="zwchr"><div style="color:#000;font-weight:normal;font-style:normal;text-decoration:none;font-family:Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:12pt;"><b>From: </b>"Maybellene Gamboa" <maypgamboa@gmail.com><br><b>To: </b>adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org<br><b>Sent: </b>Tuesday, January 26, 2016 8:59:20 PM<br><b>Subject: </b>[adegenet-forum] sPCA - memory exceeded, can run in parallel?<br><div><br></div><div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>I am performing sPCA with 228 individuals and 9,273 SNPs. Every time I try to run it, the memory is exceeded in R. Can this command be run in parallel? Does it work for very large datasets? Any help would be greatly appreciated!</div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>Maybellene Gamboa<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div>Maybellene P. Gamboa<div>PhD Student, Department of Biology</div><div>Graduate Degree Program in Ecology</div><div>Colorado State University <br></div></div><div>Office: Anatomy/Zoology E339</div><div>Phone: (562) 676-6960</div><div>E-mail: <a href="mailto:mgamboa@rams.colostate.edu" target="_blank">mgamboa@rams.colostate.edu</a></div><div>Alt. e-mail: <a href="mailto:maypgamboa@gmail.com" target="_blank">maypgamboa@gmail.com</a></div></div></div>

</div></div>

<br>_______________________________________________<br>adegenet-forum mailing list<br>adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org<br>https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum</div><div><br></div></div></body></html>