<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>      I have recently been using the various features of adegenet unsing genind objects and I works great so far. However, I can't seem to be able to find easy summary stats:</div><div><br></div><div>Observed heterozygosity per population: this would be very handy but I only found the function Hs (expected heterozygosity).</div><div><br></div><div>Global allele frequencies per loci: there is a nice histogram of minor allele frequencies on page 30 of the adegenet genomic tutorial, but I can't find how to generate the same plot using genind objects.</div><div><br></div><div>Thank you very much for your help,</div><div><br></div><div>Simon<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div>
<font size="4" color="#3d85c6">Simon Nadeau, M. Sc.</font></div><div><font color="#3d85c6"><font size="3">Biologiste / Biologist</font></font></div><div><strong><font color="#007f00" size="3"></font></strong><br></div><div><div>Ressources naturelles Canada, Service canadien des forêts, Centre de foresterie des Laurentides / Natural Resources Canada, Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre</div><div>1055 rue du P.E.P.S., C.P. 10380 succ. Sainte-Foy, Québec (Québec), Canada G1V 4C7</div></div><div><a href="mailto:Simon.Nadeau.UBC@gmail.com" style="font-size:12.8000001907349px" target="_blank">Simon.Nadeau@a</a><span style="font-size:12.8000001907349px;color:rgb(0,0,255)"><a href="http://lumni.ubc.ca" target="_blank">lumni.UBC.ca</a>, </span><u style="color:rgb(0,0,255);font-size:12.8000001907349px"><div style="display:inline!important"><a href="mailto:Simon.Nadeau@RNCan-NRCan.gc.ca" target="_blank">Simon.Nadeau@canada.ca</a></div></u></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px">Tel: (604) 349-5196</span><br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div>