<div dir="ltr"><div style="font-size:12.8000001907349px">Hello,</div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">I am trying to create a genind object from a genepop file, then replace missing data with mean. Missing data is indicated by 0's in the genepop file. When I check for NAs, none are recognized. Why isn't adegenet recognizing missing data in my genepop file?</div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><div>> Coho <- read.genepop("Input/20pop10loci.gen", ncode = 3L)</div><div><br></div><div> Converting data from a Genepop .gen file to a genind object... </div><div><br></div><div><br></div><div>File description:  coho data dec 2014 </div><div><br></div><div>...done.</div><div><br></div><div>> sum(<a href="http://is.na/" target="_blank">is.na</a>(Coho$tab))</div><div>[1] 0</div><div><pre style="white-space:pre-wrap;color:rgb(0,0,0)"><br></pre><div>I'm new to this, so sorry for any duplicate posts.</div><div>Thank you!</div></div></div><div><br></div><br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div></div></div></div></div></div>
</div>