<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 12 (filtered medium)">
<style>
<!--
 /* Font Definitions */
 @font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Cambria;
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:"Segoe UI";
        panose-1:2 11 5 2 4 2 4 2 2 3;}
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.StileMessaggioDiPostaElettronica17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
@page Section1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:70.85pt 2.0cm 2.0cm 2.0cm;}
div.Section1
        {page:Section1;}
-->
</style><!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapelayout v:ext="edit">
  <o:idmap v:ext="edit" data="1" />
 </o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="IT" link="blue" vlink="purple">
<div class="Section1">
<p class="MsoNormal"><i><span lang="EN-US" style="font-size:13.5pt;color:black;
background:white">Hi Thibaut and all,<o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><span lang="EN-US" style="font-size:13.5pt;color:black;
background:white"><o:p> </o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><span lang="EN-US" style="font-size:13.5pt;color:black;
background:white">I was trying to visualize what kind of genetic structure I can obtain with my data using the DAPC analysis. I have already filtered the dataset (i.e. missing
 data, MAF etc) but I have realized there are some loci with a strange deviation from the others that could affect the results of the DAPC. These strange distribution of those loci is clearer underlined doing a PCA. Is there a way to know the name of these
 loci in order to investigate deeply about them or in case to filter them out?<o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><span lang="EN-US" style="font-size:13.5pt;color:black;
background:white"><o:p> </o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><span lang="EN-US" style="font-size:13.5pt;color:black;
background:white">Many thanks in advance.<o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><span lang="EN-US" style="font-size:13.5pt;color:black;
background:white">Best,<br>
Carlo<o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><b><span lang="EN-US" style="font-size:12.0pt;font-family:"Cambria","serif";color:#1F497D;background:
white">--<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><b><span lang="EN-US" style="font-size:12.0pt;font-family:"Cambria","serif";color:#1F497D;background:
white"><o:p> </o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><b><span lang="EN-US" style="font-size:12.0pt;font-family:"Cambria","serif";color:#1F497D;background:
white">Carlo Pecoraro, PhD Candidate</span></b><span lang="EN-US" style="font-size:13.5pt;font-family:"Segoe UI","sans-serif";color:black"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><b><span lang="EN-US" style="font-size:12.0pt;font-family:"Cambria","serif";color:#1F497D;background:
white"><br>
</span></b><i><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;color:#1F497D;
background:white">Laboratory of Genetics & Genomics of Marine Resources and Environment (GenoDREAM)<br>
Dept.</span></i><i><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;color:#1F497D"> <span style="background:white">Biological, Geological & Environmental Sciences (BiGeA)<br>
University of Bologna<br>
Via S. Alberto 163, 48123 Ravenna (Italy)</span></span></i><i><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;color:#1F497D;background:white"><o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><i><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;color:#1F497D;background:white"><o:p> </o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><i><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;color:#1F497D">IRD (Institut de Recherche pour le Développement)<br>
UMR 212 EME (Ecosytèmes Marins Exploités)<br>
BP 570<br>
Victoria, Mahé<br>
Seychelles<o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><i><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;color:#1F497D;background:white"><br>
</span></i><i><span style="font-size:10.0pt;color:#1F497D;background:white">Ph: +39 3337603101</span></i><i><span style="font-size:10.0pt;color:#1F497D"><o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal" style="background:white"><i><span style="font-size:10.0pt;
color:#1F497D;background:white">skype contact: carlo_pecoraro</span></i><i><span style="font-size:10.0pt;color:#1F497D"><o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
</body>
</html>