<div dir="ltr"><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div>Dear All,</div><div><br></div><div>I was trying to analyze my data (2408 haploid fungal isolate genotyped using 17 SSR markers) using 'adegenet' program .</div><div><br></div><div>However, I am little bit uncertain how to determine the number of clusters based on the rate of changes of BIC that I observed from my result. I am attaching herewith my output files. I chose 3, 4, 5 9 and 10 clusters. Every time they grouped into three clusters. Should I consider 3 cluster then?</div><div><br></div><div>I will appreciate your suggestions with explanations. </div><div><br></div><div>Just another question, is there anyway to see or extract a table from 'adegenet' about which individual belongs to which cluster? </div><div><br></div><div>Thanks<br clear="all"></div><div><div><div dir="ltr"><div><strong><font face="times new roman,serif">Sajed Islam</font></strong></div></div></div></div></div><font face="times new roman,serif"><div></div><p><span style="color:rgb(31,73,125);font-family:"Calibri","sans-serif";font-size:11pt"><font color="#0066cc" face="courier new,monospace" size="2"><a href="mailto:Sajedul.Islam@ars.usda.gov" target="_blank"></a></font></span></p></font></div></div></div>
</div>