<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>oops, sorry. </p>
<p>I have 203 nodes...</p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<div><font size="2" face="Tahoma">
<div dir="ltr"><font color="#000000" size="3" face="Comic Sans MS"><em><strong></strong></em></font></div>
</font></div>
</div>
</div>
</div>
Regards,
<div>Genevieve<br>
<br>
<div style="color: rgb(0, 0, 0);">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Jombart, Thibaut <t.jombart@imperial.ac.uk><br>
<b>Sent:</b> 30 July 2015 01:24 PM<br>
<b>To:</b> Diedericks, G, Me <gend@sun.ac.za>; adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org<br>
<b>Subject:</b> RE: MSPA</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt"><br>
The graph may be too large for your computer to handle? Rendering of large graphs is typically slow on R's graphic devices. How many nodes do you have?<br>
<br>
Best<br>
Thibaut<br>
<br>
ps: please keep the forum Cced<br>
<br>
<br>
<div>
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:10pt"></span></font></div>
</div>
</div>
<div style="font-family:Times New Roman; color:#000000; font-size:16px">
<hr tabindex="-1">
<div id="divRpF682847" style="direction:ltr"><font face="Tahoma" size="2" color="#000000"><b>From:</b> Diedericks, G, Me <gend@sun.ac.za> [gend@sun.ac.za]<br>
<b>Sent:</b> 30 July 2015 12:07<br>
<b>To:</b> Jombart, Thibaut<br>
<b>Subject:</b> Re: MSPA<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>Hi,</p>
<p><br>
</p>
<p>Thanks for the speedy reply! I did as you suggested, but my R session keeps on bombing out or hanging (I am using Rstudio).</p>
<p>Any suggestions on how to fix this?</p>
<p><br>
</p>
<p>Thank you.</p>
<p><br>
</p>
<p>Kind regards,</p>
<p>Genevieve</p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<div><font face="Tahoma" size="2">
<div dir="ltr"><font face="Comic Sans MS" size="3" color="#000000"><em><strong></strong>
<div dir="ltr"><br>
</div>
</em></font></div>
</font></div>
</div>
</div>
</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Jombart, Thibaut <t.jombart@imperial.ac.uk><br>
<b>Sent:</b> 30 July 2015 12:37 PM<br>
<b>To:</b> Diedericks, G, Me <gend@sun.ac.za>; adegenet-forum@lists.R-forge.R-project.org<br>
<b>Subject:</b> RE: MSPA</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt"><font size="2">Hi there,
<br>
<br>
if I remember well, chooseCN has an option to edit the graph manually / interactively. The interface is a bit clunky but it should do the trick.
<br>
<br>
Just set the argument edit.nb=TRUE when creating your graph. <br>
<br>
Cheers<br>
Thibaut<br>
<br>
<br>
</font>
<div style="font-family:Times New Roman; color:#000000; font-size:16px">
<hr tabindex="-1">
<div id="divRpF828831" style="direction:ltr"><font face="Tahoma" size="2" color="#000000"><b>From:</b> adegenet-forum-bounces@lists.r-forge.r-project.org [adegenet-forum-bounces@lists.r-forge.r-project.org] on behalf of Diedericks, G, Me <gend@sun.ac.za> [gend@sun.ac.za]<br>
<b>Sent:</b> 30 July 2015 10:24<br>
<b>To:</b> adegenet-forum@lists.R-forge.R-project.org<br>
<b>Cc:</b> Diedericks, G, Me <gend@sun.ac.za><br>
<b>Subject:</b> [adegenet-forum] MSPA<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>Good day,</p>
<p><br>
</p>
<p>I'm trying to run a MSPA for a freshwater fish species, sampled at 10 sites along a river. I have chosen the Delaunay Triangulation, but need to edit the connections as some of the sites are below a dam wall, so the fish cannot move back up the river. Could
 you please assist me with this? </p>
<p><br>
</p>
<p>Kind regards,</p>
<p>Genevieve</p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">
<div><font face="Tahoma" size="2">
<div dir="ltr"><font face="Comic Sans MS" size="3" color="#000000"><em><strong>
<hr>
</strong>
<div dir="ltr"><font size="3" color="#ff0080"><em><font face="Century Schoolbook"><strong>Genevieve
<font color="#ff0080">Diedericks</font></strong></font></em></font></div>
<div dir="ltr"><font face="Century Schoolbook" size="2" color="#ff0080"><em></em></font></div>
<div dir="ltr"><font face="Century Schoolbook" size="2" color="#ff0080"><em>PhD candidate ~ Zoology</em></font></div>
<div dir="ltr"><em><font face="Century Schoolbook" size="2" color="#ff0080">Centre for Invasion Biology (C.I.B)</font></em></div>
<div dir="ltr"><em><font face="Century Schoolbook" size="2" color="#ff0080">Department of Botany & Zoology</font></em></div>
<div dir="ltr"><em><font face="Century Schoolbook" size="2" color="#ff0080">Stellenbosch University</font></em></div>
<div dir="ltr"><em><font face="Century Schoolbook" size="2" color="#ff0080">South Africa</font></em></div>
<div dir="ltr"><font face="Century Schoolbook" size="2" color="#ff0080"><em>+27 (0) 21 808 4135</em></font></div>
</em></font></div>
</font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>