
<html dir="ltr">

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>

</head>

<body ocsi="0" fpstyle="1">

<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;"><br>

<div><font size="2">Hi there, <br>

<br>

genind objects can be subsetted like matrices, e.g. x[foo, ]<br>

where foo is a subset of individuals. Should be documented in the adegenet basics tutorial.<br>

<br>

Best<br>

<br>

Thibaut<br>

</font></div>

<div style="font-family: Times New Roman; color: #000000; font-size: 16px">

<hr tabindex="-1">

<div style="direction: ltr;" id="divRpF152401"><font size="2" color="#000000" face="Tahoma"><b>From:</b> adegenet-forum-bounces@lists.r-forge.r-project.org [adegenet-forum-bounces@lists.r-forge.r-project.org] on behalf of Mark Coulson [coulsonmw@gmail.com]<br>

<b>Sent:</b> 03 December 2014 13:53<br>

<b>To:</b> adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org<br>

<b>Subject:</b> [adegenet-forum] removing groups of individuals from genind object<br>

</font><br>

</div>

<div></div>

<div>

<div dir="ltr">

<div>Hello,</div>

<div><br>

</div>

<div>This is probably quite simple, but I have done a DAPC on a large number of samples (~300) and have found quite good separation between samples from a couple of very unique sites and the rest of the dataset. I'd like to now run another DAPC on just the

 remaining samples (i.e. kick out the most distinct groups) and am wondering how to easiest remove whole samples of individuals from the genind file (say pop70-pop100), rather than having to make a separate input file. I think I could do this with a normal

 dataframe but not sure about a genind object??</div>

<div><br>

</div>

<div>Cheers,</div>

<div>Mark</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</body>

</html>