<div dir="ltr">For this purpose, it would also be adequate to just change sep from "/" to " / ", but I suppose there may be other reasons to want to remove the white spaces. <div><br></div><div>Cheers, <br>
Caitlin. </div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jun 17, 2014 at 3:08 PM, Jombart, Thibaut <span dir="ltr"><<a href="mailto:t.jombart@imperial.ac.uk" target="_blank">t.jombart@imperial.ac.uk</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
Ahah, well spotted! I totally missed it.<br>
<br>
Yep, open your file, remove all white spaces, and it should fly.<br>
<br>
Cheers<br>
Thibaut<br>
________________________________________<br>
From: <a href="mailto:adegenet-forum-bounces@lists.r-forge.r-project.org">adegenet-forum-bounces@lists.r-forge.r-project.org</a> [<a href="mailto:adegenet-forum-bounces@lists.r-forge.r-project.org">adegenet-forum-bounces@lists.r-forge.r-project.org</a>] on behalf of Miguel Navascués [<a href="mailto:m.navascues@gmail.com">m.navascues@gmail.com</a>]<br>

Sent: 17 June 2014 15:01<br>
To: <a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org">adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org</a><br>
<div class="im HOEnZb">Subject: Re: [adegenet-forum] SNP alleles<br>
<br>
</div><div class="HOEnZb"><div class="h5">In one of your messages (below) there seem to be spaces in addition to<br>
"/" separating the alleles. May be worth to check if that can cause the<br>
problem.<br>
<br>
Best<br>
<br>
Miguel<br>
<br>
On 17/06/14 14:47, Andrea Garavito wrote:<br>
>  >test<-myData[1:10,1:10]<br>
>  >test<br>
>      loc_29      loc_7       loc_43  etc...<br>
> 1  "G / A"      "C / T"     "T / T"<br>
> 2  "G / G"      "C / T"     "T/ T"<br>
> etc...<br>
<br>
<br>
--<br>
Miguel NAVASCUÉS, PhD<br>
<br>
Chargé de Recherche (CR2) INRA<br>
<br>
UMR CBGP Centre de Biologie pour la Gestion des Populations<br>
Institut National de la Recherche Agronomique<br>
Campus International de Baillarguet, CS 30016<br>
34988 Montferrier-sur-Lez (France)<br>
<br>
phone:  +33(0)4.99.62.33.70<br>
fax:    +33(0)4.99.62.33.45<br>
e-mail: miguel.navascues AT <a href="http://supagro.inra.fr" target="_blank">supagro.inra.fr</a><br>
e-mail: m.navascues AT <a href="http://gmail.com" target="_blank">gmail.com</a><br>
Skype:  m.navascues<br>
web:    <a href="http://www1.montpellier.inra.fr/cbgp/" target="_blank">http://www1.montpellier.inra.fr/cbgp/</a><br>
web:    <a href="http://sites.google.com/site/navascuesresearch/" target="_blank">http://sites.google.com/site/navascuesresearch/</a><br>
_______________________________________________<br>
adegenet-forum mailing list<br>
<a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org">adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum" target="_blank">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum</a><br>
_______________________________________________<br>
adegenet-forum mailing list<br>
<a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org">adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum" target="_blank">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>