<div dir="ltr">Hi all,<br clear="all"><div><br>

<p class="">In my genind object I would like to select only the loci
with a certain genotype (e.g. 0102). Then I wanna check the allele contribution
($var.contr).</p>

<p class=""> If I digit: mygenindobject$all.names I get a list with xx
components yielding allele names for each locus.

</p><p class="">For instance:</p>

<p class=""> </p>

<p class="">$L262</p>

<p class=""><span style>   </span>1<span style>    </span>2</p>

<p class="">"01" "02"</p>

<p class=""> </p>

<p class="">Then, to get the loci only the loci with a certain
genotype (e.g. 0102) , I have tried with the subset function:
selectLoci<-subset(mydata$all.names, 1=="01" &
2=="02", select=c(1,2)) But then I get: named list ()</p>

<p class=""> Is there a specific function in adegenet to subset the
data? Could you please help me? <br></p><p class=""><br></p><p class="">Thank you very much,</p><p class=""><br></p><p class="">Best</p><p class=""><br></p><p class="">Jasmine<br>
</p></div></div>