<div dir="ltr">Dear adegenet users,<div><br></div><div>I am trying to optimize the number of PCA to retain for a DAPC analysis. </div><div><br></div><div>I am using the optim.a.score() command but I am getting consistently different results if I directly call optim.a.score() or if I call it by saving it in a tmp (e.g. tmp<-optim.a.score(x)). </div>
<div><br></div><div>With the first syntax I get around 35 optimal PCA and with the second syntax I get around 20. Is this a negligible difference? Any idea why I am getting this results consistently different?</div><div><br>
</div><div>Thanks in advance!</div><div><br clear="all"><div>Margarita</div></div></div>