<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii"><meta name=Generator content="Microsoft Word 14 (filtered medium)"><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Tahoma","sans-serif";
        color:windowtext;
        font-weight:normal;
        font-style:normal;
        text-decoration:none none;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        mso-fareast-language:EN-US;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=EN-GB link=blue vlink=purple><div class=WordSection1><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Tahoma","sans-serif"'>Dear all,<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Tahoma","sans-serif"'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Tahoma","sans-serif"'>I am using adegenet sPCA for the first time, so apologies if this has been asked before, however, I couldn’t find any information from a search of the archives.  <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Tahoma","sans-serif"'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Tahoma","sans-serif"'>I wish to edit the Delaunay triangulation to be used in an sPCA analysis.  I have successfully created the Neighbour List object using chooseCN from my data, but the editor it invokes, “edit.cn”, is very difficult to use, displays my data very poorly (many nodes are too close on the screen image), and doesn’t appear to reference its nodes with the individual ids in my data.  Therefore, I wonder if anyone could describe another way, in R or not, that I could use to remove some of the unwanted edges in the triangulation?  <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Tahoma","sans-serif"'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Tahoma","sans-serif"'>Many thanks for your help.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Tahoma","sans-serif"'><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-family:"Tahoma","sans-serif"'>Peter<o:p></o:p></span></p></div></body></html>